More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3407 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  79.89 
 
 		 544 aa  849    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  90.64 
 
 		 547 aa  914    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  90.74 
 
 		 551 aa  919    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  79.22 
 
 		 542 aa  835    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  91.54 
 
 		 551 aa  916    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  90.56 
 
 		 551 aa  916    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  78.58 
 
 		 552 aa  810    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  77.06 
 
 		 559 aa  853    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  79.93 
 
 		 541 aa  843    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  90.56 
 
 		 551 aa  919    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 545 aa  1073    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  99.45 
 
 		 545 aa  1067    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  77.72 
 
 		 556 aa  855    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  81.9 
 
 		 535 aa  860    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  89.57 
 
 		 547 aa  906    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  95.41 
 
 		 547 aa  973    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  56.05 
 
 		 553 aa  567  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  52.66 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  50.94 
 
 		 528 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  51.52 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  52 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  49.15 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  47.4 
 
 		 535 aa  439  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  44.55 
 
 		 542 aa  438  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  45.87 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  43.61 
 
 		 528 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.53 
 
 		 524 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  45.92 
 
 		 523 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  50.93 
 
 		 545 aa  332  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  41.17 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  27.58 
 
 		 574 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 		 565 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 		 595 aa  126  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 		 592 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  25.09 
 
 		 576 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.71 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.59 
 
 		 620 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.73 
 
 		 575 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.68 
 
 		 620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  26.85 
 
 		 541 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.83 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 		 562 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.83 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.66 
 
 		 620 aa  110  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  23.52 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.27 
 
 		 620 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.49 
 
 		 620 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.27 
 
 		 620 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.88 
 
 		 620 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.27 
 
 		 620 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.27 
 
 		 620 aa  110  8.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.27 
 
 		 620 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.88 
 
 		 620 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  27.27 
 
 		 620 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  24.21 
 
 		 566 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.83 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  27.57 
 
 		 649 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  22.79 
 
 		 566 aa  108  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  27.47 
 
 		 620 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  25.85 
 
 		 574 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.47 
 
 		 620 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  26.9 
 
 		 650 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  26.24 
 
 		 562 aa  107  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  27.93 
 
 		 564 aa  107  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 		 656 aa  107  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  26.67 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.07 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  26.77 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.85 
 
 		 543 aa  105  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7792  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC (K(+)/H(+) antiporter)  29.06 
 
 		 509 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  25.32 
 
 		 563 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.24 
 
 		 617 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  25.93 
 
 		 563 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.61 
 
 		 671 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.68 
 
 		 621 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26 
 
 		 605 aa  103  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  25.24 
 
 		 649 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  25.19 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1723  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.85 
 
 		 580 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  26.9 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  25.42 
 
 		 562 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  25.84 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  25.05 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 		 581 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  25.84 
 
 		 558 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  25.84 
 
 		 558 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  24.1 
 
 		 540 aa  101  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  25.84 
 
 		 558 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  27.7 
 
 		 572 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  25.84 
 
 		 558 aa  101  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1635  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.7 
 
 		 583 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  25.66 
 
 		 558 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  25.74 
 
 		 563 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 		 666 aa  100  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  25.66 
 
 		 558 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>