More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0545 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  89.76 
 
 
547 aa  908    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  90.64 
 
 
547 aa  912    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  90.74 
 
 
551 aa  918    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  79.11 
 
 
542 aa  835    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  79.7 
 
 
544 aa  846    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  91.54 
 
 
551 aa  916    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  76.88 
 
 
559 aa  850    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  79.56 
 
 
541 aa  840    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  90.56 
 
 
551 aa  916    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  78.4 
 
 
552 aa  807    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  99.45 
 
 
545 aa  1067    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
545 aa  1072    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  90.56 
 
 
551 aa  918    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  77.72 
 
 
556 aa  855    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  95.41 
 
 
547 aa  972    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  81.9 
 
 
535 aa  861    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  55.86 
 
 
553 aa  565  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  52.47 
 
 
529 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  50.94 
 
 
528 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  51.81 
 
 
527 aa  495  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  51.33 
 
 
529 aa  498  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  48.96 
 
 
534 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  44.36 
 
 
542 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  47.21 
 
 
535 aa  437  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  45.68 
 
 
531 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  43.42 
 
 
528 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  42.91 
 
 
524 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  45.92 
 
 
523 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  50.66 
 
 
545 aa  330  4e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  41.36 
 
 
520 aa  266  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  27.94 
 
 
574 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 
558 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  28.23 
 
 
595 aa  127  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  23.86 
 
 
565 aa  126  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  27.65 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  27.72 
 
 
592 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  25.26 
 
 
576 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.9 
 
 
575 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.51 
 
 
539 aa  115  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  26.8 
 
 
562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.79 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.88 
 
 
620 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  26.65 
 
 
541 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.62 
 
 
541 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  23.52 
 
 
566 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.62 
 
 
541 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  27.47 
 
 
620 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  24.25 
 
 
566 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  26.02 
 
 
574 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.47 
 
 
620 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.47 
 
 
620 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.47 
 
 
620 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.47 
 
 
620 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  27.47 
 
 
620 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.47 
 
 
620 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  27.77 
 
 
546 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  27.34 
 
 
649 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.68 
 
 
620 aa  108  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.68 
 
 
620 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.68 
 
 
620 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.62 
 
 
541 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  22.79 
 
 
566 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  27.73 
 
 
564 aa  107  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  26.99 
 
 
561 aa  106  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  26.85 
 
 
558 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  25.35 
 
 
540 aa  106  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  27.27 
 
 
620 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  26.6 
 
 
571 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  26.71 
 
 
650 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.27 
 
 
620 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  26.06 
 
 
562 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  25.51 
 
 
563 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 
656 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7792  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein kefC (K(+)/H(+) antiporter)  29.06 
 
 
509 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  25.76 
 
 
551 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  26.11 
 
 
563 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  22.85 
 
 
543 aa  104  5e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  25.19 
 
 
561 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  25.24 
 
 
649 aa  103  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  26.03 
 
 
558 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  25.6 
 
 
562 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 
679 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 
581 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  26.03 
 
 
558 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.24 
 
 
617 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  26.03 
 
 
558 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  26.03 
 
 
558 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  26.03 
 
 
558 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  25.93 
 
 
563 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  25.44 
 
 
621 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  25 
 
 
561 aa  101  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  28.51 
 
 
720 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02890  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.56 
 
 
605 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  25.84 
 
 
558 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  25.84 
 
 
558 aa  101  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  25.84 
 
 
558 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1723  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.85 
 
 
580 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  25.43 
 
 
671 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  25.71 
 
 
666 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  25.05 
 
 
556 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>