More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3267 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  80.41 
 
 		 551 aa  826    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  80.22 
 
 		 551 aa  823    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  80.41 
 
 		 547 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 542 aa  1068    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  81.84 
 
 		 547 aa  819    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  80.41 
 
 		 551 aa  826    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  87.38 
 
 		 541 aa  880    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  84.21 
 
 		 552 aa  857    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  79.7 
 
 		 559 aa  863    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  80.59 
 
 		 551 aa  827    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  78.93 
 
 		 545 aa  815    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  79.11 
 
 		 545 aa  816    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  80.11 
 
 		 556 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  87.41 
 
 		 544 aa  909    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  80.41 
 
 		 547 aa  820    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  80.31 
 
 		 535 aa  845    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  53.61 
 
 		 553 aa  543  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  52.87 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  52.3 
 
 		 529 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  50 
 
 		 528 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  50.76 
 
 		 527 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  49.43 
 
 		 534 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  45.73 
 
 		 535 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  43.13 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  45.87 
 
 		 531 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  42.86 
 
 		 528 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  41.27 
 
 		 524 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  44.92 
 
 		 523 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  50.27 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  40.52 
 
 		 520 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 558 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  25.14 
 
 		 565 aa  136  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  27.31 
 
 		 595 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  26.31 
 
 		 574 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  28.74 
 
 		 546 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  27.08 
 
 		 592 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  27.21 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  27.62 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  24.63 
 
 		 576 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  27.66 
 
 		 566 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  27.62 
 
 		 562 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  27.44 
 
 		 563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  26.11 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  25.96 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  28.83 
 
 		 572 aa  118  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  27.14 
 
 		 562 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  27.27 
 
 		 561 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  26.9 
 
 		 563 aa  117  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  28.68 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  26.9 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  24.37 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  26.23 
 
 		 541 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.78 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.78 
 
 		 541 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  26.87 
 
 		 566 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  26.8 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.57 
 
 		 541 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  27 
 
 		 564 aa  114  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  25.95 
 
 		 574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  26.42 
 
 		 548 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.51 
 
 		 620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.41 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  27.34 
 
 		 650 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  26.09 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  25.39 
 
 		 581 aa  108  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  26.95 
 
 		 562 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  27.22 
 
 		 667 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.3 
 
 		 620 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  24.91 
 
 		 662 aa  107  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.32 
 
 		 543 aa  106  8e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  25.94 
 
 		 649 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  26.99 
 
 		 558 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  25.88 
 
 		 598 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0751  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 581 aa  106  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  26.99 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  27.31 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.09 
 
 		 620 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  27.31 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  27.31 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  27.31 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  26.99 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  25.33 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  26.99 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  27.31 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  26.99 
 
 		 558 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  25.48 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  27.19 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  26.8 
 
 		 558 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.09 
 
 		 620 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  26.8 
 
 		 558 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  27.44 
 
 		 679 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  26.7 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  26.8 
 
 		 558 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1067  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.78 
 
 		 541 aa  104  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000268693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  28.09 
 
 		 620 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  25.37 
 
 		 567 aa  104  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  24.3 
 
 		 571 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  24.38 
 
 		 656 aa  103  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.230483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>