More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0415 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4016  sodium/hydrogen exchanger  78.19 
 
 		 541 aa  834    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000212571 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3727  sodium/hydrogen exchanger  75.86 
 
 		 551 aa  808    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0653  sodium/hydrogen exchanger  78.05 
 
 		 544 aa  826    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0695  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  77.33 
 
 		 547 aa  792    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0662  sodium/hydrogen exchanger  75.86 
 
 		 551 aa  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3248  sodium/hydrogen exchanger  76.2 
 
 		 547 aa  793    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3267  sodium/hydrogen exchanger  79.7 
 
 		 542 aa  829    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.389403  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0635  sodium/hydrogen exchanger  75.86 
 
 		 551 aa  809    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0415  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 559 aa  1107    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0582  sodium/hydrogen exchanger  76 
 
 		 552 aa  781    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0658  sodium/hydrogen exchanger  75.68 
 
 		 551 aa  808    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3407  sodium/hydrogen exchanger  77.06 
 
 		 545 aa  805    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.792145  normal  0.0393803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0545  sodium/hydrogen exchanger  76.88 
 
 		 545 aa  803    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.408022  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3667  sodium/hydrogen exchanger  82.49 
 
 		 556 aa  905    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3577  sodium/hydrogen exchanger  77.51 
 
 		 547 aa  806    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.549647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0537  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  78.18 
 
 		 535 aa  825    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  0.013329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1105  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  52.93 
 
 		 553 aa  541  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004131  putative Glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  53.35 
 
 		 529 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01333  hypothetical protein  52.58 
 
 		 529 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0513  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  50.1 
 
 		 528 aa  495  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0828  sodium/hydrogen antiporter  50.67 
 
 		 527 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1189  sodium/hydrogen exchanger  49.9 
 
 		 534 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2640  sodium/hydrogen exchanger  46.24 
 
 		 535 aa  429  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1223  sodium/hydrogen exchanger  45.08 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0693873  normal  0.0816945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4111  sodium/hydrogen exchanger  43.76 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0610  sodium/hydrogen exchanger  43.24 
 
 		 542 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.554486  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2306  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  40.54 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3453  sodium/hydrogen exchanger  43.25 
 
 		 523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02051  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  48.53 
 
 		 545 aa  309  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00514196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2255  sodium/hydrogen exchanger  39.61 
 
 		 520 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.221603 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  25.75 
 
 		 565 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2771  sodium/hydrogen exchanger  27.61 
 
 		 595 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1863  sodium/hydrogen exchanger  26.74 
 
 		 558 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1095  sodium/hydrogen exchanger  28.3 
 
 		 562 aa  123  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4196  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.57 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1895  sodium/hydrogen exchanger  25.53 
 
 		 574 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1997  sodium/hydrogen exchanger  25.82 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4612  sodium/hydrogen exchanger  25.18 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180321 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1145  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.021897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0413  sodium/hydrogen exchanger  24.44 
 
 		 566 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.706339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1795  sodium/hydrogen exchanger  24.25 
 
 		 566 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315073  unclonable  0.0000000110445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3569  Sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 592 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.278233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1199  sodium/hydrogen exchanger  27.57 
 
 		 546 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.399558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3158  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 		 547 aa  113  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.833464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2938  sodium/hydrogen exchanger  27.9 
 
 		 547 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.26 
 
 		 539 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3552  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 		 551 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.341909  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0606  TrkA-N, Sodium/hydrogen exchanger  25.69 
 
 		 574 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2284  sodium/hydrogen exchanger  27.36 
 
 		 572 aa  110  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.608384  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.18 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.18 
 
 		 541 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0974  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.55 
 
 		 543 aa  110  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.705651  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  26.89 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  27.39 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  28.17 
 
 		 628 aa  108  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4337  carbonic anhydrase  27.78 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0494  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.18 
 
 		 541 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  28.16 
 
 		 720 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0835  sodium/hydrogen exchanger  26.79 
 
 		 561 aa  107  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  26.54 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  26.15 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1614  sodium/hydrogen exchanger  27.29 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2094  sodium/hydrogen exchanger  25.45 
 
 		 541 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0776  sodium/hydrogen exchanger family protein  26.73 
 
 		 541 aa  105  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  29.98 
 
 		 674 aa  103  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  27.98 
 
 		 628 aa  103  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2772  sodium/hydrogen exchanger  25.05 
 
 		 571 aa  103  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.48581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1424  sodium/hydrogen exchanger  26.84 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  27.8 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0930  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0096  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.5 
 
 		 620 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.467251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  26.42 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  26.4 
 
 		 649 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.32 
 
 		 620 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00050  hypothetical protein  26.42 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0596  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.41 
 
 		 621 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0053  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.42 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1861  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.18 
 
 		 540 aa  101  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000013758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0041  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.42 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  26.61 
 
 		 562 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.5 
 
 		 620 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0051  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.42 
 
 		 620 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.903961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  28.94 
 
 		 589 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  26.56 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  25.88 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0049  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.32 
 
 		 620 aa  101  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709743 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  27.62 
 
 		 666 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0095  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.85 
 
 		 620 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0089  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.29 
 
 		 620 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  28.25 
 
 		 667 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0091  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  27.29 
 
 		 620 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.422534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  25.33 
 
 		 598 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  22.78 
 
 		 650 aa  99.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3552  potassium efflux system protein  26.22 
 
 		 620 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  24.56 
 
 		 584 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3608  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  26.22 
 
 		 620 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457228 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  26.56 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  25.85 
 
 		 648 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3304  sodium/hydrogen exchanger  27.07 
 
 		 679 aa  98.2  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0626661  normal  0.119921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  24.95 
 
 		 673 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>