79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0325 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  100 
 
 		 138 aa  278  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  66.42 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001353  biopolymer transport protein ExbD1  64.93 
 
 		 137 aa  176  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1753  TonB system transport protein ExbD1  54.23 
 
 		 141 aa  148  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.82 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3672  TonB system transport protein ExbD1  48.78 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.78 
 
 		 145 aa  103  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3341  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.11 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00402112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0949  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.11 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.543665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1051  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.28 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1018  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.11 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198442  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0963  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.59 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.89 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  31.62 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.61 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3132  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.81 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.58 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.13 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  23.39 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.71 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.46 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.58 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.59 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  24.22 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.43 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  20.8 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.41 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  23.81 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.39 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1943  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  21.77 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2300  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  23.81 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.562465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.76 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  32.52 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  19.67 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.39 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.66 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.39 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  28.93 
 
 		 136 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.55 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  20.83 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  30.65 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1701  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0404269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.85 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  27.19 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  27.5 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1736  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.88 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  20.8 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  29.23 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  22.4 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  22.4 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  22.4 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.4 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  23.81 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.19 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.98 
 
 		 148 aa  40  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.26 
 
 		 142 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 133 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  29.06 
 
 		 133 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>