27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0787 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425493  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.6 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.26 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.85 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3341  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.59 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00402112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0949  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.59 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.543665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1051  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.59 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1018  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.79 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3672  TonB system transport protein ExbD1  49.31 
 
 		 145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0963  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.22 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1753  TonB system transport protein ExbD1  42.15 
 
 		 141 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00438106  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  38.06 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001353  biopolymer transport protein ExbD1  36.23 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  39.34 
 
 		 138 aa  84  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.56 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  25.41 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.58 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.62 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  26.23 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  27.87 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.8 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.8 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2402  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.67 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.705571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.58 
 
 		 141 aa  40  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>