156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001353 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001353  biopolymer transport protein ExbD1  100 
 
 		 137 aa  273  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  87.41 
 
 		 137 aa  239  7e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  64.93 
 
 		 138 aa  176  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1753  TonB system transport protein ExbD1  53.68 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00438106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3672  TonB system transport protein ExbD1  45.97 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3341  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.08 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00402112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0949  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.08 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.543665  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1051  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.26 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1018  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.08 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198442  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 137 aa  97.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.23 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0963  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.64 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.57 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  22.83 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  26.52 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.6 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  28.1 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.63 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  28 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  21.43 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.76 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  21.01 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  25 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  28.1 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  25 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  22.13 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  24.8 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  25.2 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.83 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.85 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.22 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.12 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0652382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  24 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0534  protein TolR  23.81 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.156343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  29.03 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.79 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  24.22 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.4 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.71 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.4 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.22 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  32.77 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.8 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.8 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.58 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  24.22 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.62 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.603451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  21.54 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  22.95 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.8 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0305  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.88 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.199404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  22.4 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.4 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1275  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.29 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.146064  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  22.4 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  30.43 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.92 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2750  tolr protein  20 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  23.49 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  24.22 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  21.23 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.25 
 
 		 133 aa  43.5  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  21.26 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1567  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.64 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  28.23 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  26.15 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  22.83 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  26.15 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  20.47 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0319  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586711  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  19.2 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.44 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0679  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57915  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0802  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.15 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0696  protein TolR  26.15 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.219875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0771  protein TolR  26.15 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  26.15 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  26.15 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  26.15 
 
 		 149 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  26.15 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.82 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  18.66 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  21.6 
 
 		 144 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>