52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0963 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0963  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 145 aa  280  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1051  biopolymer transport protein ExbD/TolR  80 
 
 		 145 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0949  biopolymer transport protein ExbD/TolR  79.31 
 
 		 145 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.543665  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3341  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  79.31 
 
 		 145 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00402112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1018  biopolymer transport protein ExbD/TolR  77.93 
 
 		 145 aa  219  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3672  TonB system transport protein ExbD1  72.41 
 
 		 145 aa  200  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.9 
 
 		 145 aa  190  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.29 
 
 		 137 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.72 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.22 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425493  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  49.59 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1753  TonB system transport protein ExbD1  44.62 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00438106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001353  biopolymer transport protein ExbD1  41.18 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  40.16 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  26.56 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.21 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.55 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 		 135 aa  47.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  26.89 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  25.21 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  29.27 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  24.22 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.46 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.58 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  24.58 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  24.58 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  24.58 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.03 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1522  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.58 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.64 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.93 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  26.32 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.64 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  22.79 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  27.69 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  25.76 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1460  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00381179  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  20.63 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  24.8 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  24.8 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.93 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.44 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.29 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.48 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  20.61 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.58 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  25.32 
 
 		 149 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>