57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3341 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3341  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00402112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0949  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 145 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.543665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1051  biopolymer transport protein ExbD/TolR  99.31 
 
 		 145 aa  279  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.59996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1018  biopolymer transport protein ExbD/TolR  97.24 
 
 		 145 aa  275  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.03 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0963  biopolymer transport protein ExbD/TolR  79.31 
 
 		 145 aa  199  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3672  TonB system transport protein ExbD1  71.03 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.89 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.1 
 
 		 137 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.756364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.59 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.425493  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1753  TonB system transport protein ExbD1  43.85 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00438106  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001353  biopolymer transport protein ExbD1  45.08 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  47.11 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05242  biopolymer transport protein  42.15 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2088  tolR protein  28.46 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00030908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  21.54 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  26.67 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2531  biopolymer transport protein  25.2 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000400528  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2566  biopolymer transport TolR  25.41 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2941  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000159512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  27.93 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  24.39 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.66 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  23.62 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  20.14 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1392  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000255119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.39 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  23.62 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4538  TolR protein  23.66 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.62 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51740  TolR protein  23.66 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101841  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.81 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  23.62 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.39 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.1 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.58 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4088  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.87 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.091049  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  21.6 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  26.85 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  21.6 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.37 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3412  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 135 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.544248 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  17.48 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  24.32 
 
 		 136 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1413  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3974  tolR protein  25.19 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0054859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.2 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  25.22 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6883  putative TolR protein  19.01 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604254  normal  0.0755944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>