More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0395 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0395  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
151 aa  294  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30482  hitchhiker  0.000338676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4033  biopolymer transport protein ExbD/TolR  76.67 
 
 
158 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439813  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4176  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  77.33 
 
 
158 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0919098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4149  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  80.77 
 
 
159 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0136307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2097  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.08 
 
 
164 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0862483  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  35.62 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  33.8 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.39 
 
 
142 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  31.33 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.39 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.39 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.39 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.39 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.39 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  32.39 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  32.39 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.62 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.93 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  34.09 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  35.34 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.62 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  33.33 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  33.87 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.29 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  34.33 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.17 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  32.26 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  33.81 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  33.59 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.39 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.32 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  35.38 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  32.31 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.33 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.29 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.93 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  28.91 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  31.62 
 
 
143 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  28.91 
 
 
153 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  27.13 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3472  protein TolR  38.3 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0578496  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.89 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  34.62 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  33.09 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  31.25 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  32.31 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  33.06 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.82 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.5 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  31.71 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  36.23 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 
134 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  27.34 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.78 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.81 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  32.14 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  36.23 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  34.11 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  33.08 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  34.13 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  29.25 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  31.62 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.13 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>