More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2091 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
140 aa  283  8e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0833564  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.82 
 
 
137 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.36 
 
 
143 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.08 
 
 
143 aa  147  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.91 
 
 
138 aa  147  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.04 
 
 
141 aa  147  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
144 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.36 
 
 
142 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  50.36 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
142 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1509  biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  51.11 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.171101  normal  0.278773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.55 
 
 
144 aa  133  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3216  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.43 
 
 
141 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  48.23 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2642  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.74 
 
 
147 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.71 
 
 
141 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
140 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  35 
 
 
154 aa  100  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  37.14 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  34.51 
 
 
142 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  34.33 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  37.01 
 
 
146 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.28 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  37.01 
 
 
146 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  34.31 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
142 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0313  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
141 aa  84  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.34 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.1 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0605408  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2305  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1899  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000511207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.61 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3815  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446813  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  29.41 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1510  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.43562  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1061  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  26.87 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1317  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.893415  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.33 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  29.37 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  28.91 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  32.03 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.51 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.05 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  25.93 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2097  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.57 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0862483  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  33.86 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.36 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.79 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  29.63 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.04 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  31.16 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  28.68 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.22 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1151  TonB system transport protein ExbD2  28.79 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3007  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.8 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  31.2 
 
 
142 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  27.07 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.12 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  29.46 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.23 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.23 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  30.23 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.23 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.88 
 
 
139 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  32.28 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  30.23 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>