72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0184 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 136 aa  263  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2341  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0374372  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.75 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.14 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2128  hypothetical protein  27.73 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0468443  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1613  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.63 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.921592  normal  0.194939 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  30.7 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.93 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  25.93 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.19 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  26.32 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  30.17 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0351  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.96 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14750  Biopolymer transport protein ExbD  36.27 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.71 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3332  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156003  normal  0.605878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2091  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.43 
 
 		 149 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0300188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3846  biopolymer transport protein ExbD/TolR family  27.48 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.661546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25500  hypothetical protein  32.04 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.236019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  27.21 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1375  tolR protein  24.44 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.103721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2179  hypothetical protein  30.61 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0568  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  23.58 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1344  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.63 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0455  biopolymer transport protein (ExbD2)  27.12 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0057258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1516  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.79 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.890263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0829  TolR protein  25.81 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2079  tolR protein  25.81 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.02 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2663  tolR protein  25.81 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1634  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0335583  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  29.01 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  23.89 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1947  TolR protein  25.81 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.79 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3201  TolR protein  25.81 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3254  tolR protein  25.81 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  33.63 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3239  TolR protein  25.81 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0826525  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1268  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 156 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0930334  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  26.05 
 
 		 147 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 141 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  22.41 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2306  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.7 
 
 		 156 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426715  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3966  TonB system transport protein ExbD  27.27 
 
 		 149 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  26.87 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.93 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.73 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.73 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  32.26 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3918  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833668  normal  0.0813936 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0325  TonB system transport protein ExbD1  27.05 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000982985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.33 
 
 		 137 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>