More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0452 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
134 aa  258  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.38 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  33.33 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.61 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2060  GTP cyclohydrolase I  31.21 
 
 
143 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.552907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.16 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1190  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.693897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  33.09 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  32.52 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0584856  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
166 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1247  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0568  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1742  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.31 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.12 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1227  tolR protein  34.31 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.31 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.31 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  27.64 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.78 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1028  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.69 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000374903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.83 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  30.7 
 
 
135 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  30.77 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.61 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2024  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.94 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.34025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  29.27 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.66 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0564  protein TolR  33.06 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.434395  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.48 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0146  protein TolR  29.75 
 
 
150 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  34.45 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.19 
 
 
142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2012  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.81 
 
 
219 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  31.75 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  31.78 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  28.21 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0581  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000412701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  31.62 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.77 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0453  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.47 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00775346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0244  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.08 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.2 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.42 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  27.42 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  31.67 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  31.67 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.91 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  33.61 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  33.61 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  32.85 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0844  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.51 
 
 
183 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0364273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  33.61 
 
 
142 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  35.61 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  31.03 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  26.05 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3209  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537129  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1525  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.81 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0168753  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  26.05 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  30.83 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.44 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  30.83 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.61 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2231  TolR protein  32.61 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1740  biopolymer transport TolR  32.12 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000388711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.05 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>