179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0440 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 140 aa  272  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.8 
 
 		 134 aa  83.6  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.92 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.92 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.58 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3571  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.23 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161015  decreased coverage  0.00354496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0536  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000196939  hitchhiker  0.000000905807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.62 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0351  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.32 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  30.95 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2948  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1239  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.371549  normal  0.35298 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0285  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.05 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  30.89 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  25.81 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  25.81 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3522  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  27.87 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1555  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2304  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0677093  normal  0.134165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.1 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.310639 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  32.5 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  27.56 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0568  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2565  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.69 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  hitchhiker  0.00490818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  26.61 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  30.3 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.95 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  31.45 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2484  putative biopolymer transport exbD-related transmembrane protein  27.91 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0200822  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.26 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.35 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.57 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4449  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.17 
 
 		 207 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  28.81 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1924  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.83 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.645056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  28.1 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  28.32 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.87 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  30 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0748  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  23.08 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  26.15 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  26.05 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.5 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2806  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0047121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2554  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.34 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.89 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.41 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4176  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0268987  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  27.34 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0468443  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.14 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  28.99 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2529  biopolymer transport EXBD-like transmembrane protein  27.07 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.161438  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.54 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.9 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1847  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.730316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  26.77 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.42 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  26.61 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  23.02 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0066  protein TolR  26.98 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.659052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0065  TolR protein  26.98 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  23.02 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.67 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.21 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2892  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.2 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000482573 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  27.12 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  24.81 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1435  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.559612  normal  0.665441 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.47 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  25.64 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.74 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>