15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0351 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0351  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2128  hypothetical protein  51.54 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0468443  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.74 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.31 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.93 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.16 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.54 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.01 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  25.64 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.09 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.96 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>