147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4087 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.53 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.68 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2155  biopolymer transport protein (ExbD2)  31.34 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.23 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0438  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.06 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.744335  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.46 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.8 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1063  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.26 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1656  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.55 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0846  ExbD2-like biopolymer transport protein  26.36 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.424366  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0609  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.83 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000633887  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00634  biopolymer transport protein  28.12 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1520  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.07 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0568  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.68 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1827  TonB system transport protein ExbD2  26.32 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03432  Biopolymer transport protein  31.45 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0592  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.71 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.127488 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2461  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.086318  hitchhiker  0.000000463213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2531  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.103764  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00138445  hitchhiker  0.00000106541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1643  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.158333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3869  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.48 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1665  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.283534  normal  0.123341 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.37 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2715  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.32 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0091845  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.28 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2422  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00108653  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0902  TonB system transport protein ExbD3  26.28 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.58 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  27.01 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02811  Biopolymer transport protein  29.84 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0477065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2649  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00438318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.81 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00147196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0927503  normal  0.0158805 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0114  TonB system transport protein ExbD2  25.55 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.69 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2151  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0691787  normal  0.335965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.5 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.5 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1257  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.64 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.529196  hitchhiker  0.000136221 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06757  hypothetical protein  26.28 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  21.32 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3973  biopolymer transport exbD protein  28.23 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3753  biopolymer transport exbD protein  25.21 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.677985  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2428  biopolymer transport ExbD like protein  29.63 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.303812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.75 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  25.19 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0351  hypothetical protein  30.16 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2987  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.65 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.369399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.41 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.02 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001859  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.09 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  25.37 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.52 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000935089  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.64 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2817  biopolymer transport protein (ExbD2)  30.58 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276974  hitchhiker  0.00000182227 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  28.81 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.19 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  25.19 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  29.03 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  27.91 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.93 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000845  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.55 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4069  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0174  TonB system transport protein ExbD  30.58 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1618  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272583  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  31.36 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2475  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.31 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.71842  hitchhiker  0.0000457301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  24.26 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  29.41 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  25.69 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  25.69 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0355  branched-chain amino acid aminotransferase I  24.44 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00931363  normal  0.438435 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.09 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  27.56 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0546  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00922706  normal  0.113975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  27.42 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  25.37 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2923  biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.71 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.986403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  21.8 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2955  putative TolR-like translocation protein  27.14 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  26.56 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  22.48 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>