38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1436 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1436  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 133 aa  255  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2128  hypothetical protein  45.74 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0468443  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0351  hypothetical protein  45.74 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0452  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0324206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.4 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1846  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0874  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.37 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4373  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1012  TonB system transport protein  29.37 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0560  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.62 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.326497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0184  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.84 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.340668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.06 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0227736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4167  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.03 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.27 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2677  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.8 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2614  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3004  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  26.72 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0793  biopolymer transport protein ExbD/TolR  24 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4087  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.41 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0244495  normal  0.590384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4238  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0912  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.2 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0769  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  25.2 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.08 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4166  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  26.72 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0600  biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.48 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4372  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.91 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  28.21 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.66 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1506  biopolymer transport protein  25.93 
 
 		 136 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000178844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  27.97 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0733  putative TOLR-related transport transmembrane protein  23.44 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.670063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1563  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  23.57 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0568  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.06 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  25.66 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  28.99 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  24.41 
 
 		 134 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  24.41 
 
 		 134 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>