More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3971 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3971  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 279 aa  528  1e-149  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0785973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1447  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1442  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.200576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1877  transcriptional regulator, LysR family  40.19 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.018924  normal  0.0294674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 316 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3406  transcriptional regulator, LysR family  36.14 
 
 		 336 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3535  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 323 aa  89  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3211  LysR substrate-binding  35.64 
 
 		 323 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.847319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 302 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6822  LysR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 375 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2173  transcriptional regulator, LysR family  28.88 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 318 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 301 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  44.19 
 
 		 304 aa  85.9  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  30.52 
 
 		 293 aa  85.5  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 305 aa  85.5  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 298 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5862  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1190  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2452  transcriptional regulator, LysR family  68.18 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.429303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  46.51 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  46.51 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0631  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808562  normal  0.903361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  51.16 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  54.84 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  48.51 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  48.51 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.42 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7661  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  51.35 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  44.19 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  48.35 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6126  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  50.56 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  57.33 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3639  transcriptional regulator, LysR family  35.19 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  57.33 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  37.43 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3928  transcriptional regulator, LysR family  35.19 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2953  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  37.43 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  51.69 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>