More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0670 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  100 
 
 		 330 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  74.61 
 
 		 325 aa  490  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.69 
 
 		 327 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70 
 
 		 323 aa  450  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.54 
 
 		 324 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  70.53 
 
 		 340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.15 
 
 		 323 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.15 
 
 		 323 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.15 
 
 		 323 aa  442  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.72 
 
 		 329 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  65.54 
 
 		 323 aa  434  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.42 
 
 		 326 aa  434  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  69.91 
 
 		 340 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.19 
 
 		 327 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.18 
 
 		 326 aa  424  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.67 
 
 		 336 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.91 
 
 		 327 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  68.35 
 
 		 330 aa  415  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.11 
 
 		 327 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.14 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.83 
 
 		 333 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  66.25 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  63.86 
 
 		 335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.35 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.63 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  61.7 
 
 		 351 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.54 
 
 		 329 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  66.36 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  62.54 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  63.91 
 
 		 329 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  60.12 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  62.66 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.67 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  63.87 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  61.54 
 
 		 328 aa  359  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  59.76 
 
 		 344 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 		 340 aa  342  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  52.73 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.17 
 
 		 326 aa  318  7e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.53 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.24 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.53 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.21 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.32 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.32 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.85 
 
 		 327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.52 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.69 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.11 
 
 		 322 aa  309  5e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.15 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2111  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.84 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.39 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2913  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2778  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0997001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.06 
 
 		 352 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.39 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.34 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  49.08 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2870  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.65 
 
 		 321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.58 
 
 		 322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  50.79 
 
 		 325 aa  305  6e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.68 
 
 		 326 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.34 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0171  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 		 324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.9 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.98 
 
 		 324 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.59 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  46.3 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2529  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.21 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.77 
 
 		 333 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.81 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.59 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.17 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.29 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.6 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.23 
 
 		 327 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.59 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.84 
 
 		 333 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.98 
 
 		 336 aa  299  4e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.96 
 
 		 335 aa  299  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.15 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  48.92 
 
 		 325 aa  298  6e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  52.78 
 
 		 327 aa  298  9e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  49.85 
 
 		 340 aa  298  9e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.79 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.79 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 352 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 		 350 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.46 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.35 
 
 		 338 aa  296  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.39 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0188  Porphobilinogen synthase  48.78 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>