More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2111 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2870  delta-aminolevulinic acid dehydratase  96.91 
 
 		 324 aa  634    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2111  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 324 aa  666    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2913  delta-aminolevulinic acid dehydratase  96.6 
 
 		 324 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2778  delta-aminolevulinic acid dehydratase  96.6 
 
 		 324 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0997001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3751  delta-aminolevulinic acid dehydratase  81.79 
 
 		 324 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0528618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0412  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.22 
 
 		 324 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0424  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.22 
 
 		 324 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0516895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0406  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.22 
 
 		 324 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0466  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.22 
 
 		 324 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0404  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.53 
 
 		 324 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.956627  hitchhiker  0.00000000427813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.16 
 
 		 324 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.131985 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00319  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.58 
 
 		 324 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3238  Porphobilinogen synthase  76.27 
 
 		 324 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3259  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.27 
 
 		 324 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0433  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.27 
 
 		 324 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0393  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.27 
 
 		 324 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0284  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.27 
 
 		 324 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00323  hypothetical protein  76.58 
 
 		 324 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0444  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.27 
 
 		 324 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0398  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.95 
 
 		 324 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0171  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 		 324 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0141  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.24 
 
 		 327 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.81 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.227907  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2426  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.575079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1892  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 327 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.3598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1755  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.539106  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1858  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 327 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1885  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 327 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0074  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.63 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2434  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 		 327 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432476  normal  0.214406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.46 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0303  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.93 
 
 		 332 aa  355  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.942552  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2183  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.74 
 
 		 332 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2392  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.38 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2587  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.7 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2260  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.05 
 
 		 332 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.63 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 323 aa  321  9.000000000000001e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.63 
 
 		 323 aa  321  9.999999999999999e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.06 
 
 		 325 aa  319  3e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 322 aa  319  3e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.27 
 
 		 325 aa  316  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.52 
 
 		 327 aa  315  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 326 aa  315  8e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  50.16 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 324 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.23 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  49.84 
 
 		 328 aa  312  5.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 323 aa  311  9e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.44 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.27 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.06 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.74 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.73 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.59 
 
 		 341 aa  308  8e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  52.09 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.1 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  51.89 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.26 
 
 		 327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.86 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  52.02 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.43 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.99 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.99 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.9 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.36 
 
 		 327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 329 aa  305  6e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  53.64 
 
 		 327 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.36 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 329 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  53.69 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1771  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.75 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.17 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.04 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.54 
 
 		 339 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.86 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.46 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  50.47 
 
 		 330 aa  301  7.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.11 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  49.84 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.52 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.68 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0981  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.95 
 
 		 327 aa  299  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  50.94 
 
 		 336 aa  298  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.36 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.36 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.36 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.04 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.04 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  49.69 
 
 		 325 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>