More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2160 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
326 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 
325 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.98 
 
 
324 aa  465  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.09 
 
 
324 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.68 
 
 
339 aa  448  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.4 
 
 
326 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.75 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.51 
 
 
326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.41 
 
 
325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 
337 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.19 
 
 
326 aa  441  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.37 
 
 
325 aa  437  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.86 
 
 
325 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.99 
 
 
325 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.78 
 
 
324 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.21 
 
 
325 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.28 
 
 
322 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  62.35 
 
 
328 aa  432  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.61 
 
 
326 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.96 
 
 
326 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 
329 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  62.65 
 
 
330 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.06 
 
 
324 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.75 
 
 
321 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.43 
 
 
321 aa  420  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.75 
 
 
323 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  63.07 
 
 
327 aa  414  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  62.35 
 
 
330 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  64.8 
 
 
336 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.32 
 
 
326 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
329 aa  414  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 
327 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.86 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.65 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.86 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  62.46 
 
 
324 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.55 
 
 
324 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  58.77 
 
 
326 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 
323 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  61.42 
 
 
325 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
315 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  54.86 
 
 
325 aa  395  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  55.49 
 
 
325 aa  394  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.15 
 
 
327 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.86 
 
 
328 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.86 
 
 
328 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 
327 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 
329 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 
327 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 
327 aa  388  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.68 
 
 
341 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.1 
 
 
327 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.37 
 
 
325 aa  388  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.1 
 
 
327 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  58.31 
 
 
325 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 
325 aa  388  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.05 
 
 
331 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.17 
 
 
323 aa  385  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 
323 aa  387  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.87 
 
 
322 aa  387  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.41 
 
 
334 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.55 
 
 
331 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 
324 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 
325 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.1 
 
 
324 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 
325 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.55 
 
 
318 aa  378  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.06 
 
 
343 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.98 
 
 
352 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
326 aa  374  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 
327 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
341 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.19 
 
 
341 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.9 
 
 
341 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.5 
 
 
336 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55 
 
 
322 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 
322 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0288  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.96 
 
 
328 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0794  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.57 
 
 
327 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.535148  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 
356 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.74 
 
 
352 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.26 
 
 
328 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.06 
 
 
333 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
335 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
322 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  55.14 
 
 
325 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
328 aa  364  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.27 
 
 
334 aa  364  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.26 
 
 
328 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.35 
 
 
340 aa  361  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>