More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0385 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
323 aa  665    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  76.78 
 
 
325 aa  537  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.83 
 
 
325 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.9 
 
 
325 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.9 
 
 
325 aa  494  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.19 
 
 
323 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.9 
 
 
327 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.59 
 
 
327 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.54 
 
 
326 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0794  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.99 
 
 
327 aa  448  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.535148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 
337 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.7 
 
 
325 aa  418  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 
339 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 
339 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 
325 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.94 
 
 
325 aa  412  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 
326 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 
325 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  58.13 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 
326 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.74 
 
 
325 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.31 
 
 
325 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 
326 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.37 
 
 
324 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.42 
 
 
329 aa  381  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  55.03 
 
 
330 aa  381  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
325 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  57.81 
 
 
330 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.97 
 
 
322 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
329 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.11 
 
 
329 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 
326 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 
329 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 
329 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 
329 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 
329 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 
329 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 
329 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
329 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 
329 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.48 
 
 
329 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
326 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.82 
 
 
352 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.87 
 
 
326 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
324 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  55.56 
 
 
336 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  51.08 
 
 
325 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  56.03 
 
 
327 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
324 aa  364  1e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.24 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.24 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.41 
 
 
324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
324 aa  360  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  55.14 
 
 
325 aa  361  1e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.96 
 
 
341 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.96 
 
 
341 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.96 
 
 
341 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
321 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 
324 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.39 
 
 
321 aa  359  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.73 
 
 
341 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
325 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  54.93 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.35 
 
 
327 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
328 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
328 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.7 
 
 
343 aa  351  7e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.02 
 
 
335 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.24 
 
 
323 aa  351  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  52.73 
 
 
326 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
323 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.93 
 
 
331 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 
324 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.39 
 
 
327 aa  346  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.1 
 
 
326 aa  346  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
325 aa  345  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.93 
 
 
327 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0288  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 
328 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.48 
 
 
315 aa  340  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
327 aa  340  2.9999999999999998e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
331 aa  338  5e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.23 
 
 
346 aa  338  5e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.23 
 
 
334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2529  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.85 
 
 
326 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  49.53 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
318 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
327 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
315 aa  333  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  49.53 
 
 
325 aa  332  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1771  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 
331 aa  331  9e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1772  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.75 
 
 
331 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.35 
 
 
322 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3449  Porphobilinogen synthase  49.06 
 
 
322 aa  328  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.09 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 
322 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0141  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
327 aa  325  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.81 
 
 
336 aa  325  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.17 
 
 
330 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>