More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2392 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  100 
 
 
325 aa  665    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0288  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.11 
 
 
328 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.23 
 
 
331 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  68.14 
 
 
325 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2902  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.95 
 
 
333 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.22 
 
 
325 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 
329 aa  407  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 
329 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 
329 aa  407  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 
329 aa  408  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.3 
 
 
329 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.56 
 
 
329 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 
329 aa  408  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 
329 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 
329 aa  408  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.65 
 
 
330 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.076505  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.94 
 
 
329 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.44 
 
 
324 aa  401  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.87 
 
 
323 aa  391  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 
324 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 
324 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.86 
 
 
339 aa  388  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
324 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.99 
 
 
337 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 
324 aa  388  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.22 
 
 
326 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 
325 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 
339 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.81 
 
 
326 aa  384  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.76 
 
 
324 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.63 
 
 
326 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 
341 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.02 
 
 
325 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 
341 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
323 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.51 
 
 
325 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 
341 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.51 
 
 
326 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.73 
 
 
324 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.36 
 
 
341 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.36 
 
 
325 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  59.81 
 
 
326 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.49 
 
 
325 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.29 
 
 
326 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.61 
 
 
335 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  54.57 
 
 
328 aa  368  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.19 
 
 
321 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
325 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  60.61 
 
 
324 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
326 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  57.43 
 
 
336 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.55 
 
 
321 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 
325 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.65 
 
 
318 aa  364  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  55.41 
 
 
330 aa  363  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  55.41 
 
 
330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  52.85 
 
 
325 aa  362  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.95 
 
 
328 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.95 
 
 
328 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.55 
 
 
327 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.87 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.54 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0015  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.767271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.13 
 
 
329 aa  355  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1362  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.57 
 
 
326 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.414153  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.2 
 
 
315 aa  354  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
352 aa  354  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0925  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.77 
 
 
326 aa  353  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412734  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.22 
 
 
322 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  54.69 
 
 
327 aa  352  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.46 
 
 
326 aa  352  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.85 
 
 
322 aa  352  5e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  52.68 
 
 
325 aa  352  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
324 aa  352  7e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  56.33 
 
 
327 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.93 
 
 
343 aa  350  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 
327 aa  349  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2529  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.2 
 
 
326 aa  349  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.94 
 
 
325 aa  349  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
326 aa  349  4e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.16 
 
 
322 aa  348  5e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.52 
 
 
322 aa  348  7e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.92 
 
 
317 aa  348  8e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 
327 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2019  Porphobilinogen synthase  52.27 
 
 
333 aa  348  1e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  57.73 
 
 
325 aa  347  1e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
327 aa  345  6e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 
347 aa  344  1e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 
327 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.88 
 
 
327 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.04 
 
 
322 aa  340  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.88 
 
 
327 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
325 aa  339  4e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.63 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0188  Porphobilinogen synthase  51.88 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.29 
 
 
333 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
346 aa  333  2e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>