More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1372 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 331 aa  680    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.11 
 
 		 327 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.77 
 
 		 325 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.5 
 
 		 324 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2529  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 		 326 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.05 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.6 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.94 
 
 		 321 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.94 
 
 		 321 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.11 
 
 		 325 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.03 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.05 
 
 		 324 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  56.35 
 
 		 330 aa  381  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.76 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.8 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.65 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.21 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.9 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.63 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.42 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  55.8 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  57.37 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  55.25 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.65 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 329 aa  358  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 		 329 aa  358  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 		 329 aa  358  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 329 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 		 322 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 		 315 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.07 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  54.22 
 
 		 326 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  52.68 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.17 
 
 		 322 aa  349  5e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.78 
 
 		 327 aa  348  6e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.02 
 
 		 323 aa  348  8e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.29 
 
 		 341 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.59 
 
 		 343 aa  347  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 327 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.26 
 
 		 327 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1200  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.2 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  52.96 
 
 		 325 aa  346  4e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 		 323 aa  345  5e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.32 
 
 		 326 aa  345  6e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.86 
 
 		 322 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  54 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.06 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  52.48 
 
 		 336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.36 
 
 		 341 aa  342  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.06 
 
 		 341 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.31 
 
 		 331 aa  342  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.02 
 
 		 326 aa  341  9e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 323 aa  338  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3449  Porphobilinogen synthase  50.95 
 
 		 322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.9 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  53.92 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 		 327 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 		 324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  50.47 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 325 aa  336  3.9999999999999995e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 324 aa  335  5.999999999999999e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1771  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 331 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0288  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 		 328 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  54.52 
 
 		 325 aa  330  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2902  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.9 
 
 		 333 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.118535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 		 350 aa  330  1e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 		 327 aa  329  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.06 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.04 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1772  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 		 331 aa  328  7e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.63 
 
 		 318 aa  328  7e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1362  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.414153  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  49.85 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>