More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0806 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  100 
 
 		 340 aa  682    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.47 
 
 		 327 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  62.12 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.86 
 
 		 327 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.61 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.58 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.06 
 
 		 336 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.04 
 
 		 350 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.83 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.13 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.66 
 
 		 334 aa  402  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.13 
 
 		 336 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.63 
 
 		 333 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.78 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.39 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.36 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  60.92 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.27 
 
 		 338 aa  394  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.28 
 
 		 324 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.24 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.39 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.08 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.08 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 328 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.19 
 
 		 345 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.49 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.63 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 		 352 aa  391  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.16 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.23 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.62 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.5 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.62 
 
 		 334 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  58.59 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.02 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.79 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.41 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.04 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.57 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.19 
 
 		 330 aa  383  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.48 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.04 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.04 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.33 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.58 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.88 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.18 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.1 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.06 
 
 		 333 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.19 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.88 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02451  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.58 
 
 		 378 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  60.43 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.82 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.55 
 
 		 335 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.54 
 
 		 335 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.21 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.23 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.57 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  59.38 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.82 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.88 
 
 		 352 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  55.86 
 
 		 354 aa  374  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  63.75 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.79 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 		 322 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3756  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.05 
 
 		 340 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.57 
 
 		 334 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1051  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.49 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00488786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.96 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.06 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.88 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 333 aa  371  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.63 
 
 		 340 aa  373  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3908  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.92 
 
 		 340 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>