More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0235 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
329 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.59 
 
 
327 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.57 
 
 
324 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.32 
 
 
323 aa  444  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  70.28 
 
 
328 aa  431  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8322  Porphobilinogen synthase  68.01 
 
 
323 aa  430  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.895608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4437  Porphobilinogen synthase  75.16 
 
 
329 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  67.07 
 
 
344 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.28 
 
 
338 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0488  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.76 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668975  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  64.11 
 
 
325 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26810  porphobilinogen synthase  63.38 
 
 
340 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0551  Porphobilinogen synthase  68.73 
 
 
328 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340606  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.49 
 
 
327 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0672  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.74 
 
 
323 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209949  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5698  Porphobilinogen synthase  63.47 
 
 
335 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0679  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.74 
 
 
323 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4014  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64 
 
 
336 aa  394  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.181099  normal  0.680286 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0692  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.74 
 
 
323 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.193283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4369  Porphobilinogen synthase  70.61 
 
 
332 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  63.04 
 
 
340 aa  391  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.16 
 
 
327 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15140  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.76 
 
 
328 aa  392  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 
333 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0429  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.04 
 
 
327 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.404702  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  62.5 
 
 
328 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0620  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
326 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.2 
 
 
329 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0670  Porphobilinogen synthase  62.54 
 
 
330 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3254  Porphobilinogen synthase  59.94 
 
 
351 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1542  Porphobilinogen synthase  65.94 
 
 
329 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.347928  normal  0.882388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2765  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.11 
 
 
327 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0849088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0847  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.27 
 
 
326 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.27 
 
 
326 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3439  Porphobilinogen synthase  63.17 
 
 
330 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000368512  decreased coverage  0.00109618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  53.85 
 
 
336 aa  371  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.4 
 
 
347 aa  365  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.95 
 
 
326 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  59.44 
 
 
325 aa  358  7e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.23 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.32 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2494  Porphobilinogen synthase  60.56 
 
 
324 aa  355  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0113479  normal  0.211851 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
322 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.59 
 
 
327 aa  352  5.9999999999999994e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.69 
 
 
336 aa  351  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
322 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  58.07 
 
 
330 aa  348  7e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.76 
 
 
327 aa  347  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.24 
 
 
324 aa  346  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.5 
 
 
341 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 
326 aa  346  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.1 
 
 
341 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.5 
 
 
341 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.19 
 
 
341 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.28 
 
 
324 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.82 
 
 
336 aa  343  2e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
325 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 
325 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.97 
 
 
326 aa  341  9e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.05 
 
 
338 aa  340  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
321 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.42 
 
 
324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.42 
 
 
326 aa  339  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.87 
 
 
335 aa  339  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.1 
 
 
336 aa  339  4e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  54.94 
 
 
330 aa  338  5.9999999999999996e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  54.32 
 
 
325 aa  338  7e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  58.31 
 
 
324 aa  338  8e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.09 
 
 
322 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.41 
 
 
317 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  58.39 
 
 
327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  53.42 
 
 
328 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
327 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.23 
 
 
326 aa  334  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.14 
 
 
333 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.93 
 
 
329 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 
327 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0153691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
329 aa  331  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.86 
 
 
325 aa  330  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 
325 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.85 
 
 
326 aa  331  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.7 
 
 
326 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
329 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
329 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
329 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0509  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.24 
 
 
326 aa  330  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
329 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  53.4 
 
 
336 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
329 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
329 aa  329  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
329 aa  329  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
331 aa  328  6e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.01 
 
 
331 aa  328  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
324 aa  326  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 
329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>