More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1976 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 326 aa  658    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.9 
 
 		 324 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65 
 
 		 324 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.51 
 
 		 326 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.5 
 
 		 325 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  68.71 
 
 		 327 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64 
 
 		 326 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.7 
 
 		 343 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.8 
 
 		 326 aa  432  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.09 
 
 		 325 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  66.36 
 
 		 336 aa  427  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.42 
 
 		 339 aa  424  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.11 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.27 
 
 		 325 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.7 
 
 		 326 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.27 
 
 		 324 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.27 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  63.89 
 
 		 330 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.23 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.5 
 
 		 329 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.25 
 
 		 325 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.19 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.96 
 
 		 324 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.19 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  68.54 
 
 		 324 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.62 
 
 		 325 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  62.04 
 
 		 325 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  63.44 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.88 
 
 		 325 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.26 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  60.31 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.87 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  62.65 
 
 		 330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.85 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 		 323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.85 
 
 		 327 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.46 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.35 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.31 
 
 		 324 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.15 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.05 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.05 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.15 
 
 		 329 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 341 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 		 329 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.94 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.94 
 
 		 324 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  55.45 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.19 
 
 		 324 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  61.22 
 
 		 325 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.86 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.75 
 
 		 331 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.08 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.63 
 
 		 322 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.83 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.62 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.92 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.65 
 
 		 322 aa  383  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  60.18 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  59.11 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0288  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 		 328 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.46 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.73 
 
 		 322 aa  375  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.88 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.11 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.64 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.9 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 		 315 aa  373  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.46 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.11 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.8 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.54 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.63 
 
 		 356 aa  368  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  54.04 
 
 		 327 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.98 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.33 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  53.29 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.01 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 327 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 		 328 aa  363  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.37 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 		 326 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  54.83 
 
 		 321 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.95 
 
 		 329 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55 
 
 		 328 aa  361  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0925  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.83 
 
 		 326 aa  361  8e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 325 aa  361  9e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>