More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5386 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  100 
 
 
327 aa  670    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.15 
 
 
327 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.98 
 
 
322 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  62.12 
 
 
340 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.87 
 
 
327 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.56 
 
 
327 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.87 
 
 
336 aa  408  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.46 
 
 
333 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  59.19 
 
 
403 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 
356 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  58.88 
 
 
321 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.89 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.2 
 
 
328 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.59 
 
 
328 aa  396  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.35 
 
 
350 aa  395  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.59 
 
 
328 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
352 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.11 
 
 
328 aa  384  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.09 
 
 
324 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.8 
 
 
333 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.55 
 
 
325 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.29 
 
 
329 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.8 
 
 
336 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  57.89 
 
 
324 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.79 
 
 
331 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.89 
 
 
333 aa  374  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
352 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.97 
 
 
329 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  371  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  371  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  371  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.29 
 
 
333 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.98 
 
 
333 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.68 
 
 
333 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.01 
 
 
350 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  371  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.29 
 
 
329 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.01 
 
 
350 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.98 
 
 
333 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
329 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 
332 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 
332 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.04 
 
 
326 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.79 
 
 
331 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.03 
 
 
325 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.12 
 
 
324 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.44 
 
 
350 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
378 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 
330 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 
324 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.56 
 
 
324 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 
326 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.27 
 
 
352 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
352 aa  363  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.12 
 
 
325 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
354 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
351 aa  360  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.73 
 
 
335 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
354 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.95 
 
 
328 aa  360  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
351 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.84 
 
 
338 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
351 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.53 
 
 
322 aa  360  2e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
332 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.83 
 
 
330 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.11 
 
 
335 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
362 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
332 aa  359  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
332 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
362 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.18 
 
 
362 aa  358  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.7 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.74 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.25 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 
332 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
331 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.97 
 
 
328 aa  356  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 
332 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.8 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.11 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.19 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.7 
 
 
350 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
331 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.66 
 
 
342 aa  355  6.999999999999999e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 
338 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 
323 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>