More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3652 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 327 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  74.15 
 
 		 327 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.87 
 
 		 322 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.13 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.82 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  59.39 
 
 		 340 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.26 
 
 		 333 aa  398  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.13 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.02 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.94 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.63 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.72 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 328 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  57.46 
 
 		 403 aa  378  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.52 
 
 		 324 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.05 
 
 		 350 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.33 
 
 		 331 aa  371  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.52 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  55.8 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.49 
 
 		 325 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.19 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.91 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.99 
 
 		 378 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  57.24 
 
 		 324 aa  362  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.05 
 
 		 333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 		 324 aa  361  9e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.21 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.8 
 
 		 326 aa  360  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.21 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.21 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.75 
 
 		 333 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.55 
 
 		 332 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.55 
 
 		 332 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.31 
 
 		 324 aa  359  3e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.76 
 
 		 326 aa  359  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.13 
 
 		 333 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 		 350 aa  358  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.74 
 
 		 333 aa  358  8e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 		 329 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.21 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.75 
 
 		 329 aa  355  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.96 
 
 		 336 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 		 324 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.13 
 
 		 333 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 333 aa  355  7.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.48 
 
 		 326 aa  350  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.73 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 		 328 aa  348  8e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.29 
 
 		 363 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.78 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 		 322 aa  345  4e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.88 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  54.13 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 		 337 aa  344  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.413701  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.98 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.99 
 
 		 328 aa  343  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 		 339 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.53 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 337 aa  342  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 		 325 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02451  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.42 
 
 		 333 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.199456  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0001  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.73 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.64 
 
 		 341 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  53.89 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.88 
 
 		 332 aa  340  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.63 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.66 
 
 		 323 aa  339  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.02 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52 
 
 		 335 aa  338  8e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.88 
 
 		 326 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.16 
 
 		 334 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 		 341 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.86 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>