More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0882 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  94.51 
 
 		 352 aa  644    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  92.38 
 
 		 328 aa  633    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 328 aa  678    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.9 
 
 		 328 aa  645    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  89.94 
 
 		 328 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  86.24 
 
 		 328 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  84.71 
 
 		 350 aa  584  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.75 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.44 
 
 		 327 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  58.2 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 333 aa  394  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  57.49 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.42 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.06 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.78 
 
 		 325 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.49 
 
 		 324 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.15 
 
 		 325 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 		 356 aa  381  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.52 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.05 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.42 
 
 		 333 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.82 
 
 		 336 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  56.39 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.42 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.22 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.06 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.68 
 
 		 341 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.62 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.82 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.38 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.49 
 
 		 324 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.38 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 350 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.17 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.7 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  56.01 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  55.49 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.62 
 
 		 378 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.31 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 		 334 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.4 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.83 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.77 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.31 
 
 		 352 aa  364  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.39 
 
 		 352 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.68 
 
 		 345 aa  362  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.31 
 
 		 325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 333 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 334 aa  361  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  56.03 
 
 		 326 aa  361  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.51 
 
 		 328 aa  361  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.24 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  55.17 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.83 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.28 
 
 		 334 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 		 321 aa  359  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.07 
 
 		 343 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.37 
 
 		 326 aa  359  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 		 315 aa  359  4e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.11 
 
 		 322 aa  359  4e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 338 aa  359  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.75 
 
 		 321 aa  358  5e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 		 338 aa  358  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.39 
 
 		 336 aa  359  5e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.01 
 
 		 333 aa  358  7e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.23 
 
 		 328 aa  358  7e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 		 325 aa  358  7e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.28 
 
 		 338 aa  358  7e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.11 
 
 		 333 aa  358  8e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  56.15 
 
 		 324 aa  358  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.29 
 
 		 325 aa  358  9e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53 
 
 		 326 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 336 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.71 
 
 		 333 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  56.52 
 
 		 325 aa  356  1.9999999999999998e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.37 
 
 		 326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>