More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1498 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  95.15 
 
 		 334 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  95.15 
 
 		 334 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 333 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.64 
 
 		 333 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.76 
 
 		 345 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.21 
 
 		 332 aa  497  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.61 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.81 
 
 		 363 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.62 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.69 
 
 		 352 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.31 
 
 		 351 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.69 
 
 		 350 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.31 
 
 		 351 aa  431  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.8 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.62 
 
 		 352 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  62.01 
 
 		 353 aa  425  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.49 
 
 		 378 aa  422  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.7 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.75 
 
 		 350 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.75 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.55 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  62.39 
 
 		 329 aa  414  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.9 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.48 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.68 
 
 		 337 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.66 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.39 
 
 		 330 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.88 
 
 		 336 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 338 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.28 
 
 		 330 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.58 
 
 		 336 aa  407  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.21 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.27 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.42 
 
 		 338 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.42 
 
 		 335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.56 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 		 338 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.94 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.66 
 
 		 329 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.15 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.98 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.35 
 
 		 332 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.35 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.94 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.35 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.96 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.15 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.98 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.15 
 
 		 340 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.35 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.89 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 		 335 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.31 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.35 
 
 		 332 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.98 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.08 
 
 		 334 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.67 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.46 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.32 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.63 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.26 
 
 		 337 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.62 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.51 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.88 
 
 		 330 aa  394  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.78 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.51 
 
 		 332 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 		 333 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.88 
 
 		 334 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.26 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.94 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.51 
 
 		 332 aa  394  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.62 
 
 		 335 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.62 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.52 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.45 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.9 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.26 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.95 
 
 		 320 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.45 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.52 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.45 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0422  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.7 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.38 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0436  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.7 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  56.53 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.75 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.06 
 
 		 332 aa  388  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.7 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3904  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.7 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>