More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0306 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  97.82 
 
 		 321 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  98.44 
 
 		 332 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  97.51 
 
 		 332 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 321 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 332 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  97.51 
 
 		 332 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  98.13 
 
 		 332 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.77 
 
 		 362 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.46 
 
 		 362 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.15 
 
 		 332 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.15 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.15 
 
 		 332 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.15 
 
 		 354 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.15 
 
 		 362 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  93.46 
 
 		 332 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  89.41 
 
 		 332 aa  597  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  88.92 
 
 		 332 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  88.92 
 
 		 332 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247613  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  85.89 
 
 		 330 aa  566  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  84.91 
 
 		 331 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  84.59 
 
 		 331 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  84.33 
 
 		 331 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  84.54 
 
 		 330 aa  554  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.97 
 
 		 335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.34 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.19 
 
 		 329 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.03 
 
 		 335 aa  511  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.49 
 
 		 342 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.42 
 
 		 338 aa  511  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.86 
 
 		 355 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.51 
 
 		 349 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.77 
 
 		 338 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.06 
 
 		 335 aa  498  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 		 341 aa  494  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.08 
 
 		 358 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.19 
 
 		 343 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.2 
 
 		 336 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.05 
 
 		 338 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.44 
 
 		 334 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.01 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.25 
 
 		 334 aa  475  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.5 
 
 		 335 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.47 
 
 		 320 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.61 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.19 
 
 		 352 aa  461  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.44 
 
 		 329 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70 
 
 		 337 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.51 
 
 		 333 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.62 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  67.51 
 
 		 336 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.3 
 
 		 334 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3998  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.31 
 
 		 331 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5251  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.28 
 
 		 336 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5465  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.75 
 
 		 355 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.8 
 
 		 338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0292  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.97 
 
 		 336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4049  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.77 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  69.09 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.25 
 
 		 343 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.04 
 
 		 326 aa  448  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  65.3 
 
 		 354 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.45 
 
 		 340 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.98 
 
 		 335 aa  448  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0299  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.5 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.231605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.35 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.36 
 
 		 338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.42 
 
 		 336 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.35 
 
 		 336 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.3 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.05 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.04 
 
 		 347 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.11 
 
 		 336 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.31 
 
 		 333 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.88 
 
 		 340 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.88 
 
 		 340 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.88 
 
 		 340 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.93 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.04 
 
 		 332 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0422  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.92 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528265 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3756  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.77 
 
 		 340 aa  434  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.878292  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.3 
 
 		 335 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.15 
 
 		 327 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3904  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.92 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0436  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.61 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.61 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3734  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.61 
 
 		 336 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.92 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.3 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.89 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.52 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.89 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0396  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.3 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0169  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.4 
 
 		 348 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  65.11 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.95 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0466  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.25 
 
 		 337 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3908  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.29 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.64 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.44 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.208905  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>