More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3805 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 338 aa  693    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  83.04 
 
 		 338 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  84.38 
 
 		 329 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  86.25 
 
 		 349 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  80.66 
 
 		 335 aa  552  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  80.18 
 
 		 335 aa  551  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  80.47 
 
 		 335 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.57 
 
 		 355 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.99 
 
 		 335 aa  538  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.34 
 
 		 330 aa  534  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.81 
 
 		 330 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.2 
 
 		 331 aa  524  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.9 
 
 		 332 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.95 
 
 		 358 aa  527  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 332 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.4 
 
 		 332 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.01 
 
 		 343 aa  521  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 332 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.4 
 
 		 332 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.28 
 
 		 331 aa  520  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 		 362 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 		 362 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.7 
 
 		 362 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 		 332 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 		 331 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.41 
 
 		 342 aa  511  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.38 
 
 		 321 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.69 
 
 		 321 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.86 
 
 		 332 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.55 
 
 		 332 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247613  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.05 
 
 		 341 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.03 
 
 		 338 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.19 
 
 		 336 aa  481  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.03 
 
 		 335 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.91 
 
 		 334 aa  475  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.38 
 
 		 334 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.37 
 
 		 334 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.57 
 
 		 352 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.67 
 
 		 343 aa  461  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  66.87 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.68 
 
 		 334 aa  461  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.47 
 
 		 329 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.91 
 
 		 333 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  67.27 
 
 		 338 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.25 
 
 		 326 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  65.66 
 
 		 354 aa  454  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.67 
 
 		 337 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.47 
 
 		 336 aa  454  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5251  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 		 336 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0292  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.17 
 
 		 336 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3998  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.17 
 
 		 331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 		 337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 		 337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.07 
 
 		 338 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.37 
 
 		 336 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5465  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.17 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.07 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.07 
 
 		 338 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.57 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.91 
 
 		 338 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.37 
 
 		 332 aa  450  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.5 
 
 		 335 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.38 
 
 		 352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.35 
 
 		 333 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.36 
 
 		 340 aa  444  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4049  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.4 
 
 		 340 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.06 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.07 
 
 		 336 aa  441  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.06 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.06 
 
 		 340 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0299  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.17 
 
 		 337 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.231605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.16 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.26 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  64.86 
 
 		 329 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.08 
 
 		 340 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0169  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.53 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.96 
 
 		 333 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.38 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.31 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.55 
 
 		 350 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0466  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.47 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.56 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.24 
 
 		 350 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.25 
 
 		 340 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.97 
 
 		 336 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.07 
 
 		 335 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.67 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3904  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.67 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0422  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.67 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0436  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.37 
 
 		 335 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1822  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.05 
 
 		 336 aa  428  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0581253  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.97 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0396  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.97 
 
 		 336 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3734  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.97 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>