More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1208 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
355 aa  724    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.01 
 
 
352 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.14 
 
 
351 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.86 
 
 
351 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.86 
 
 
351 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.79 
 
 
350 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.47 
 
 
378 aa  501  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.61 
 
 
363 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.5 
 
 
350 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.22 
 
 
352 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.5 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.62 
 
 
350 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  68.91 
 
 
352 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.38 
 
 
350 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.38 
 
 
350 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.21 
 
 
360 aa  484  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.29 
 
 
345 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.83 
 
 
331 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  66.25 
 
 
329 aa  441  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  67.29 
 
 
345 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.84 
 
 
337 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.22 
 
 
337 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.73 
 
 
347 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.86 
 
 
331 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.29 
 
 
343 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.37 
 
 
355 aa  421  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  63.44 
 
 
353 aa  418  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.73 
 
 
337 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
362 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.74 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.46 
 
 
335 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.32 
 
 
334 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.32 
 
 
334 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.31 
 
 
333 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1603  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 
337 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 
332 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
332 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 
326 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.01 
 
 
332 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.44 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.44 
 
 
333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.82 
 
 
345 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 
332 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.86 
 
 
321 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.87 
 
 
331 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 
334 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.75 
 
 
330 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.81 
 
 
332 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 
331 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.25 
 
 
335 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.87 
 
 
331 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.13 
 
 
332 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247613  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.47 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.47 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.5 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.86 
 
 
321 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 
335 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.44 
 
 
334 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.37 
 
 
358 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 
343 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5465  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 
355 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.56 
 
 
332 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.26 
 
 
349 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2737  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.14 
 
 
332 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.5 
 
 
335 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 
334 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.32 
 
 
334 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.73 
 
 
340 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 
329 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
338 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1837  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.74 
 
 
336 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.86 
 
 
338 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.95 
 
 
335 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 
336 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.13 
 
 
347 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 
336 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.75 
 
 
337 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.34 
 
 
336 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 
337 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.72 
 
 
333 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.02 
 
 
343 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 
336 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.41 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
340 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.86 
 
 
333 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.63 
 
 
340 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
340 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.44 
 
 
337 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
340 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.44 
 
 
341 aa  386  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 
338 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>