More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1909 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
352 aa  709    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  95.17 
 
 
378 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  82.95 
 
 
352 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  80.34 
 
 
350 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  81.77 
 
 
352 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  79.77 
 
 
350 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  79.2 
 
 
350 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.3 
 
 
351 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.01 
 
 
351 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.3 
 
 
351 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.24 
 
 
352 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.01 
 
 
360 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.21 
 
 
350 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.51 
 
 
350 aa  488  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.5 
 
 
355 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.62 
 
 
363 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  64.2 
 
 
353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65 
 
 
331 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.69 
 
 
335 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.47 
 
 
354 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.47 
 
 
354 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.47 
 
 
362 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.76 
 
 
362 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.47 
 
 
362 aa  429  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.3 
 
 
332 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63 
 
 
332 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.69 
 
 
332 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.22 
 
 
355 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.69 
 
 
332 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.69 
 
 
332 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.77 
 
 
326 aa  426  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.69 
 
 
332 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.69 
 
 
332 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.25 
 
 
335 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.69 
 
 
332 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 
321 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.33 
 
 
335 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.44 
 
 
345 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.11 
 
 
330 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.44 
 
 
345 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.44 
 
 
321 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.67 
 
 
338 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  64.29 
 
 
329 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.08 
 
 
332 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.29 
 
 
330 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.61 
 
 
332 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.6 
 
 
334 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.29 
 
 
331 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.65 
 
 
334 aa  418  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.02 
 
 
335 aa  420  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.8 
 
 
331 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.2 
 
 
338 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.88 
 
 
349 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.04 
 
 
342 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.35 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 
334 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.49 
 
 
334 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.8 
 
 
347 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.35 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.208905  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 
343 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.78 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.97 
 
 
332 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247613  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.55 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.85 
 
 
337 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.04 
 
 
331 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.93 
 
 
334 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.06 
 
 
337 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.2 
 
 
329 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.09 
 
 
333 aa  411  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.49 
 
 
334 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.15 
 
 
336 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.35 
 
 
334 aa  411  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.85 
 
 
337 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.46 
 
 
337 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.66 
 
 
334 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.61 
 
 
334 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.92 
 
 
338 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.23 
 
 
343 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.23 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.04 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.3 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.5 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.23 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.91 
 
 
343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.19 
 
 
337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.88 
 
 
320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.73 
 
 
338 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.54 
 
 
338 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.66 
 
 
358 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.81 
 
 
336 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.19 
 
 
352 aa  401  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 
337 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.68 
 
 
345 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 
340 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.88 
 
 
347 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.08 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  59.13 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.8 
 
 
326 aa  398  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.46 
 
 
340 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 
335 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>