More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1351 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 345 aa  712    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.2 
 
 		 334 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75.76 
 
 		 333 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  76.2 
 
 		 334 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.1 
 
 		 332 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.39 
 
 		 333 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.38 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.77 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.75 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.32 
 
 		 352 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.06 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.66 
 
 		 352 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.06 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.67 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.04 
 
 		 363 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.06 
 
 		 351 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.32 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.17 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  61.4 
 
 		 353 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.04 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.5 
 
 		 360 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.62 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.97 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.97 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.68 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  61.96 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 		 334 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.36 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.77 
 
 		 329 aa  398  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.97 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.47 
 
 		 338 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.54 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.82 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.54 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 354 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.5 
 
 		 337 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 		 334 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  60.19 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.35 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.3 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.38 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 332 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.15 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.5 
 
 		 326 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.43 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.33 
 
 		 334 aa  388  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.28 
 
 		 355 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.48 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 		 362 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  58.05 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.33 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  58.54 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.15 
 
 		 331 aa  384  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 		 337 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 		 331 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 340 aa  381  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.02 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.2 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 340 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 340 aa  381  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.66 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.23 
 
 		 331 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5251  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.33 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.66 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.99 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.36 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.94 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.93 
 
 		 347 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0292  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.72 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  56.23 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5465  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.4 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.67 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.93 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.37 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.41 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.97 
 
 		 336 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 		 321 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>