More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1563 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 333 aa  681    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.64 
 
 		 333 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.18 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  77.18 
 
 		 334 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.39 
 
 		 345 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  70.92 
 
 		 306 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.93 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 		 350 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.86 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65 
 
 		 351 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.06 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.06 
 
 		 351 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.09 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.32 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.56 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.75 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.18 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.44 
 
 		 350 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.44 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.7 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 345 aa  395  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3859  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.42 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0982142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.88 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02814  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.2 
 
 		 320 aa  391  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.44 
 
 		 355 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.82 
 
 		 335 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.75 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.82 
 
 		 335 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  60 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.38 
 
 		 329 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.38 
 
 		 330 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.94 
 
 		 343 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.9 
 
 		 334 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.76 
 
 		 334 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1414  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.45 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.66 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.67 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.36 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.98 
 
 		 332 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  57.45 
 
 		 353 aa  378  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.93 
 
 		 336 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.85 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 354 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.92 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 354 aa  374  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 		 338 aa  374  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.38 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.75 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.04 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 362 aa  374  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.68 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 		 338 aa  374  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.99 
 
 		 332 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.68 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.77 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.45 
 
 		 334 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 		 331 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.73 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.5 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.93 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 		 335 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.55 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.18 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.7 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  58.64 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1603  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  54.88 
 
 		 354 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3908  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 		 340 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.52 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.15 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.31 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 337 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.91 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.95 
 
 		 336 aa  362  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  55.96 
 
 		 338 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  56.13 
 
 		 336 aa  362  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.85 
 
 		 340 aa  362  4e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>