More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1603 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1603  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 337 aa  692    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  83.63 
 
 		 337 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  83.63 
 
 		 337 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  81.85 
 
 		 337 aa  559  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.29 
 
 		 347 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.36 
 
 		 345 aa  454  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.36 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.11 
 
 		 343 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.75 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.38 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.61 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.38 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.69 
 
 		 351 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.93 
 
 		 363 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.39 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.9 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 		 352 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.52 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.56 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 		 378 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.74 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 		 334 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.19 
 
 		 326 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  55 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 		 331 aa  368  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.58 
 
 		 334 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.86 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  52.47 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 		 332 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 		 331 aa  355  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.65 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 		 333 aa  352  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 332 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 		 338 aa  351  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 332 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.96 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.31 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 		 338 aa  349  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.16 
 
 		 332 aa  350  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  50.77 
 
 		 354 aa  349  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.16 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 331 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 		 336 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 		 355 aa  348  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.32 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.92 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.92 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.75 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.07 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 		 330 aa  344  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.41 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.92 
 
 		 362 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.92 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 		 332 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 		 347 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 332 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 332 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.64 
 
 		 334 aa  342  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 		 335 aa  342  8e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 		 332 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 		 338 aa  341  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.28 
 
 		 332 aa  341  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247613  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.1 
 
 		 335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 		 335 aa  339  5e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3998  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 		 331 aa  338  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0497  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.56 
 
 		 335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.48 
 
 		 332 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 		 338 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2737  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.18 
 
 		 332 aa  335  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 		 336 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1089  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.4 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.940602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3904  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0422  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0436  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 		 328 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 		 343 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3734  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>