More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2737 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2737  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
332 aa  668    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  78.05 
 
 
330 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1089  delta-aminolevulinic acid dehydratase  75 
 
 
345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.940602  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.15 
 
 
331 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.74 
 
 
363 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.33 
 
 
335 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  64.33 
 
 
329 aa  415  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.88 
 
 
335 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.11 
 
 
330 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.42 
 
 
330 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.5 
 
 
335 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.5 
 
 
335 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  61.7 
 
 
353 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.29 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.96 
 
 
355 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.17 
 
 
352 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.35 
 
 
350 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.89 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.8 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.86 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.09 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.62 
 
 
355 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.09 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.26 
 
 
349 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.78 
 
 
351 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.88 
 
 
329 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.89 
 
 
331 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.86 
 
 
378 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.2 
 
 
343 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.04 
 
 
333 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.3 
 
 
331 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.04 
 
 
350 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.66 
 
 
352 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.04 
 
 
350 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 
343 aa  391  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.21 
 
 
331 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 
334 aa  389  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.86 
 
 
362 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 
332 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 
332 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 
332 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.98 
 
 
358 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.84 
 
 
338 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.92 
 
 
350 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
332 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1822  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.15 
 
 
336 aa  384  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0581253  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
332 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.54 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.84 
 
 
338 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.48 
 
 
338 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.51 
 
 
332 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.23 
 
 
336 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.2 
 
 
332 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.1 
 
 
362 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.51 
 
 
334 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.94 
 
 
332 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5987  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
337 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.82 
 
 
337 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.81 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.98 
 
 
333 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.84 
 
 
342 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 
336 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.81 
 
 
354 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  60.73 
 
 
336 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.19 
 
 
321 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.87 
 
 
321 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.5 
 
 
335 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.7 
 
 
332 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
337 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.81 
 
 
362 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.99 
 
 
350 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.59 
 
 
334 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
332 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.59 
 
 
334 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.82 
 
 
335 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 
336 aa  378  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.63 
 
 
332 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.76 
 
 
345 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.13 
 
 
335 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.38 
 
 
332 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5251  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.82 
 
 
336 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.2 
 
 
341 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.44 
 
 
360 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0292  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.12 
 
 
336 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.8 
 
 
335 aa  377  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296629  normal  0.374083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2809  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60 
 
 
332 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247613  normal  0.669252 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.62 
 
 
352 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.8 
 
 
335 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.42 
 
 
336 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0552848  normal  0.885365 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.57 
 
 
340 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.93 
 
 
334 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1051  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.31 
 
 
349 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00488786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.57 
 
 
340 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1532  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.43 
 
 
338 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362688  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.57 
 
 
340 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.7 
 
 
334 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0299  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.59 
 
 
337 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.231605  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.38 
 
 
333 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0466  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.23 
 
 
337 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.73 
 
 
345 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>