More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1129 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
343 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0757  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.72 
 
 
345 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.72 
 
 
345 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1262  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.59 
 
 
337 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818694  normal  0.345266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1113  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.59 
 
 
337 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0812  delta-aminolevulinic acid dehydratase  74.01 
 
 
337 aa  484  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.673784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.21 
 
 
347 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1603  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.11 
 
 
337 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.85 
 
 
352 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 
351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 
351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.62 
 
 
352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.94 
 
 
351 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65 
 
 
350 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.38 
 
 
350 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.31 
 
 
352 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.44 
 
 
350 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 
350 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.87 
 
 
350 aa  431  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.29 
 
 
355 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.53 
 
 
360 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.12 
 
 
352 aa  429  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.75 
 
 
378 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.75 
 
 
363 aa  423  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.56 
 
 
333 aa  418  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  60 
 
 
353 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.13 
 
 
334 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.13 
 
 
334 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.31 
 
 
331 aa  401  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1563  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.94 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0018344  normal  0.110847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2897  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.86 
 
 
335 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.713328  hitchhiker  0.000481254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  59.19 
 
 
329 aa  395  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.26 
 
 
334 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.57 
 
 
345 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.42 
 
 
333 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.37 
 
 
334 aa  391  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0181  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.54 
 
 
331 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.66 
 
 
340 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.66 
 
 
340 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.79 
 
 
332 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.99 
 
 
332 aa  388  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.66 
 
 
340 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.1 
 
 
332 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 
343 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.66 
 
 
330 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
332 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1547  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.25 
 
 
326 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.168411  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.17 
 
 
332 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
332 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.42 
 
 
354 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.41 
 
 
332 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.05 
 
 
321 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.42 
 
 
354 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.42 
 
 
362 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.72 
 
 
362 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.42 
 
 
362 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
332 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.41 
 
 
332 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
355 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.41 
 
 
332 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 
335 aa  375  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.01 
 
 
330 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.11 
 
 
321 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.97 
 
 
335 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 
335 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.23 
 
 
338 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 
338 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.97 
 
 
347 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.97 
 
 
335 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
338 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.17 
 
 
338 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  53.87 
 
 
354 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.97 
 
 
334 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
331 aa  371  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 
338 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.04 
 
 
336 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.35 
 
 
335 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3613  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 
332 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00143981  hitchhiker  0.00000000944676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0255  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.55 
 
 
340 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.20808 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 
342 aa  371  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 
334 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.52 
 
 
329 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.56 
 
 
336 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
331 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3004  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.87 
 
 
338 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.926977  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.33 
 
 
343 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019556 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1172  Porphobilinogen synthase  54.49 
 
 
336 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.35 
 
 
331 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.66 
 
 
335 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.18 
 
 
336 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.87 
 
 
340 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.27 
 
 
340 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4049  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 
340 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0626  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.91 
 
 
334 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.727546  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1321  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.04 
 
 
334 aa  364  1e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.672245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
336 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
336 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.917412 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.28 
 
 
337 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.9 
 
 
332 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00963243  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3734  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.48 
 
 
336 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>