More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1273 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
328 aa  673    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.78 
 
 
328 aa  491  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.96 
 
 
331 aa  465  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  67.38 
 
 
321 aa  464  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  59.69 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
328 aa  384  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.85 
 
 
327 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
327 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.84 
 
 
336 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.31 
 
 
350 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 
328 aa  371  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 
336 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.25 
 
 
352 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.96 
 
 
338 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  54.46 
 
 
327 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
328 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
328 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
328 aa  365  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
333 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.28 
 
 
333 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.91 
 
 
333 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.13 
 
 
356 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
333 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.15 
 
 
324 aa  360  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  54.18 
 
 
403 aa  357  9.999999999999999e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.52 
 
 
339 aa  354  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55 
 
 
322 aa  352  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
339 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.7 
 
 
327 aa  350  1e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.18 
 
 
335 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.18 
 
 
335 aa  349  3e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1822  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.27 
 
 
336 aa  349  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0581253  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.29 
 
 
324 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
332 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.07 
 
 
325 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.18 
 
 
358 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 
332 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
335 aa  346  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296629  normal  0.374083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.96 
 
 
335 aa  345  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
354 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
354 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
362 aa  345  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 
332 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 
332 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
332 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
362 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
332 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.27 
 
 
335 aa  345  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.33 
 
 
332 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
332 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
362 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.57 
 
 
355 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
324 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
335 aa  343  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.89 
 
 
330 aa  342  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 
326 aa  342  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.19 
 
 
343 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
326 aa  342  7e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.7 
 
 
337 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.73 
 
 
332 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
323 aa  339  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.78 
 
 
325 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.89 
 
 
333 aa  339  5e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.45 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
325 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.83 
 
 
352 aa  338  7e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.44 
 
 
334 aa  338  9e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
338 aa  338  9e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.35 
 
 
342 aa  338  9e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
334 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 
333 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.58 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.31 
 
 
321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 
324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.89 
 
 
321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.09 
 
 
325 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  50.31 
 
 
325 aa  335  5e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.19 
 
 
338 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.55 
 
 
333 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
329 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
323 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
326 aa  335  7.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  51.83 
 
 
330 aa  335  9e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 
337 aa  335  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.69 
 
 
321 aa  334  9e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.67 
 
 
331 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.5 
 
 
341 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.01 
 
 
350 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
329 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  52.58 
 
 
338 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
321 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.39 
 
 
350 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2324  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 
332 aa  333  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132661  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.07 
 
 
345 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>