More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0943 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 328 aa  679    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  92.38 
 
 		 328 aa  633    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  91.46 
 
 		 328 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  90.85 
 
 		 328 aa  624  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  89.63 
 
 		 352 aa  614  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  85.32 
 
 		 328 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  82.87 
 
 		 350 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.82 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.76 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  57.19 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.36 
 
 		 325 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  57.59 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.38 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.73 
 
 		 325 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.75 
 
 		 336 aa  392  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 		 324 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.43 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  57.32 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.68 
 
 		 324 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.72 
 
 		 327 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.32 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.93 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.33 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.39 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 		 326 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.15 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.11 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.38 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.29 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 		 336 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.6 
 
 		 329 aa  374  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.65 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  58.96 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.09 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.17 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.97 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.79 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2848  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1445  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.31 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16929  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.03 
 
 		 315 aa  368  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  55.52 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  56.47 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  56.07 
 
 		 403 aa  364  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.38 
 
 		 325 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.08 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.32 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.11 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.26 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.25 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.78 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 		 345 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.59 
 
 		 334 aa  362  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  56.48 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.55 
 
 		 328 aa  362  7.0000000000000005e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 		 378 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.52 
 
 		 328 aa  361  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.52 
 
 		 328 aa  361  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.01 
 
 		 324 aa  361  8e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55 
 
 		 326 aa  361  8e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.04 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.69 
 
 		 326 aa  359  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.38 
 
 		 350 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.06 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.46 
 
 		 351 aa  358  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.46 
 
 		 351 aa  358  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 		 352 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.15 
 
 		 351 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.24 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.77 
 
 		 350 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.42 
 
 		 336 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.45 
 
 		 325 aa  356  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  56.47 
 
 		 330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.33 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.58 
 
 		 323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1546  Porphobilinogen synthase  54.37 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>