More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0646 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
322 aa  664    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  64.98 
 
 
327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  64.87 
 
 
327 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.31 
 
 
327 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.31 
 
 
327 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  57.14 
 
 
340 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.1 
 
 
328 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.18 
 
 
356 aa  372  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.62 
 
 
328 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.31 
 
 
328 aa  368  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.94 
 
 
350 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
332 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.66 
 
 
332 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.37 
 
 
350 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.99 
 
 
338 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.78 
 
 
328 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  57.37 
 
 
403 aa  364  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
352 aa  364  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.96 
 
 
333 aa  363  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
328 aa  362  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.96 
 
 
333 aa  361  9e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.5 
 
 
350 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.35 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.12 
 
 
378 aa  355  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.86 
 
 
325 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 
352 aa  354  8.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  56.19 
 
 
321 aa  354  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.13 
 
 
333 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 
350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.65 
 
 
351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.65 
 
 
351 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.73 
 
 
336 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
324 aa  350  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0001  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.8 
 
 
333 aa  350  3e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.44 
 
 
336 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.34 
 
 
351 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.5 
 
 
352 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
333 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 
352 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.02 
 
 
324 aa  346  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.94 
 
 
331 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.61 
 
 
333 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.77 
 
 
322 aa  343  2e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.8 
 
 
325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.16 
 
 
328 aa  342  4e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.16 
 
 
332 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.29 
 
 
333 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.16 
 
 
332 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
360 aa  341  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.16 
 
 
332 aa  341  8e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 
331 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.23 
 
 
324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.12 
 
 
343 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
354 aa  338  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
354 aa  338  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.37 
 
 
328 aa  338  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
332 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
332 aa  338  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.7 
 
 
325 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  55.52 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.38 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.53 
 
 
326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.5 
 
 
362 aa  335  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.09 
 
 
326 aa  335  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02451  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.53 
 
 
333 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.199456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.14 
 
 
335 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0357  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.37 
 
 
321 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.686003 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.75 
 
 
329 aa  333  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.02 
 
 
315 aa  333  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2536  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.02 
 
 
347 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.677166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  332  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.05 
 
 
321 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  54.11 
 
 
330 aa  332  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.7 
 
 
324 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.11 
 
 
329 aa  331  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  331  1e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.2 
 
 
352 aa  331  1e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.04 
 
 
326 aa  330  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.57 
 
 
331 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
329 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.86 
 
 
334 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
330 aa  330  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.27 
 
 
345 aa  330  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.63 
 
 
330 aa  329  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
358 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.83 
 
 
326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>