More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0001 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0001  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 		 333 aa  691    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.312444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 		 327 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.85 
 
 		 327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  51.52 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.8 
 
 		 322 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  48.16 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.73 
 
 		 327 aa  341  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.46 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 352 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.7 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.39 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 		 352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.53 
 
 		 336 aa  328  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 		 351 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.94 
 
 		 331 aa  325  5e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.665288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  48.48 
 
 		 403 aa  324  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.77 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.16 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.69 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  50.64 
 
 		 321 aa  323  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 		 350 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.41 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.26 
 
 		 378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.71 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.83 
 
 		 333 aa  319  3e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.95 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.3 
 
 		 324 aa  315  8e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 		 326 aa  315  8e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 		 363 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.09 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.37 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.12 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 		 328 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.65 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.46 
 
 		 350 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.51 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 		 334 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.71 
 
 		 333 aa  308  9e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.71 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.02 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.71 
 
 		 332 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.48 
 
 		 331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.56 
 
 		 352 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.62 
 
 		 333 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.45 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.04 
 
 		 337 aa  306  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.413701  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.33 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.95 
 
 		 331 aa  305  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.35 
 
 		 336 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 332 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.39 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.56 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00566  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.29 
 
 		 326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.55 
 
 		 347 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.36 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0548  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001919  porphobilinogen synthase  47.69 
 
 		 354 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.874954  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.44 
 
 		 325 aa  301  9e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  50.66 
 
 		 324 aa  301  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.45 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.82 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3908  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.94 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.06 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2079  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.83 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.117001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.22 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.82 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.82 
 
 		 332 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.38 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0169  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.14 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 354 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 362 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  48 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 354 aa  299  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.98 
 
 		 324 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.46 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.13 
 
 		 362 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.31 
 
 		 329 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3924  Porphobilinogen synthase  47.12 
 
 		 329 aa  298  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0861463  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.66 
 
 		 352 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.46 
 
 		 326 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  42.64 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>