More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2487 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
337 aa  677    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.413701  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  57.14 
 
 
340 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 
327 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.58 
 
 
335 aa  359  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.25 
 
 
327 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.58 
 
 
335 aa  358  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4238  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
351 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.658364  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
351 aa  353  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316747  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4758  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
351 aa  351  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2988  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.78 
 
 
350 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5631  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.24 
 
 
352 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313459  normal  0.0746004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4655  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.87 
 
 
352 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213892  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2623  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.47 
 
 
350 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.660287  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 
330 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6834  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 
350 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365551  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.96 
 
 
335 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7570  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.26 
 
 
350 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.578542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.77 
 
 
330 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 
327 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.27 
 
 
336 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.15 
 
 
334 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.35 
 
 
363 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2240  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.57 
 
 
378 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.236795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 
355 aa  341  8e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.43 
 
 
333 aa  341  9e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.85 
 
 
333 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2660  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.87 
 
 
350 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.397348  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.24 
 
 
335 aa  340  2e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296629  normal  0.374083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2651  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.87 
 
 
352 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.596658 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.74 
 
 
335 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
362 aa  338  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.35 
 
 
336 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.37 
 
 
331 aa  338  7e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4295  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.12 
 
 
360 aa  338  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
334 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.27 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3805  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.72 
 
 
338 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000100968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.15 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.14 
 
 
358 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1208  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.33 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
362 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1909  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.27 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545235  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  51.67 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.64 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.68 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.64 
 
 
332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.82 
 
 
335 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00278646  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.92 
 
 
352 aa  335  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
362 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
328 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
332 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
332 aa  335  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.99 
 
 
332 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
332 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.4 
 
 
333 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3267  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
331 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0833553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
328 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  50.62 
 
 
321 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.85 
 
 
332 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2920  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.99 
 
 
331 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259754 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.38 
 
 
338 aa  332  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.77 
 
 
333 aa  332  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.1 
 
 
335 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
336 aa  332  8e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.45 
 
 
328 aa  332  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
352 aa  331  9e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0278  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.85 
 
 
340 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3938  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.85 
 
 
340 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1907  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.85 
 
 
340 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.17 
 
 
343 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2413  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.23 
 
 
347 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000852272  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.99 
 
 
342 aa  330  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.41 
 
 
329 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47450  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
337 aa  329  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.09 
 
 
333 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.47 
 
 
338 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.99 
 
 
325 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.64 
 
 
336 aa  328  7e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1498  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 
333 aa  328  8e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0245  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.97 
 
 
349 aa  328  9e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.963714  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2989  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.68 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  53.99 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.47 
 
 
338 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1822  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 
336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0581253  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.23 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4219  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  49.24 
 
 
327 aa  326  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0306  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.21 
 
 
321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.214609 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2464  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.21 
 
 
335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>