More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03605 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03605  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
328 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1273  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.78 
 
 
328 aa  491  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  65.35 
 
 
331 aa  450  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  64.31 
 
 
321 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.31 
 
 
327 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56 
 
 
327 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  57.54 
 
 
340 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.54 
 
 
328 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.92 
 
 
350 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.31 
 
 
328 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.31 
 
 
328 aa  372  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.08 
 
 
328 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.69 
 
 
328 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  53.85 
 
 
327 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 
352 aa  367  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 
336 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.91 
 
 
333 aa  362  4e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.6 
 
 
333 aa  360  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.19 
 
 
333 aa  359  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.81 
 
 
356 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.29 
 
 
332 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03881  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.91 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0840908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.32 
 
 
327 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.34 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0316  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.73 
 
 
335 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.63 
 
 
336 aa  355  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0266  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.79 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454725 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0388  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.18 
 
 
358 aa  352  7e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
324 aa  351  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0261  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.79 
 
 
335 aa  351  8.999999999999999e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0430723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0327  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.49 
 
 
335 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.135602 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
322 aa  349  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
324 aa  347  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3038  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.1 
 
 
362 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.6 
 
 
341 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2793  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.57 
 
 
334 aa  344  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2601  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
354 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3746  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
354 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  53.56 
 
 
403 aa  344  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.68 
 
 
325 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3508  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
332 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3139  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
362 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1954  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
332 aa  343  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3716  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
332 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4926  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.41 
 
 
329 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000159734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3774  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
362 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342004  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.96 
 
 
333 aa  342  5e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  54.98 
 
 
336 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
341 aa  341  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  340  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
329 aa  340  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
325 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  340  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
329 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
341 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0380  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.96 
 
 
355 aa  339  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
329 aa  338  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4105  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
338 aa  338  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0404345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3149  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.27 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0518  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.35 
 
 
338 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.151738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3286  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.67 
 
 
326 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.66 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2280  Porphobilinogen synthase  52.44 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.668376  normal  0.0129462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.39 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.74 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.61 
 
 
339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.74 
 
 
352 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162764  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0217  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.45 
 
 
333 aa  335  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
329 aa  335  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.58 
 
 
332 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113422 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0080  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.89 
 
 
342 aa  335  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000790962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3211  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.35 
 
 
336 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
327 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.89 
 
 
332 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106807  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3352  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.68 
 
 
331 aa  335  9e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.27928  normal  0.803387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0154  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.22 
 
 
333 aa  335  9e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000166942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
326 aa  334  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2729  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.19 
 
 
332 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.19 
 
 
332 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.214853  normal  0.272412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0378  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.19 
 
 
332 aa  334  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3382  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
338 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0192  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.74 
 
 
338 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19464  normal  0.949773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
339 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.96 
 
 
336 aa  333  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3801  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.05 
 
 
336 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
345 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1822  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.22 
 
 
336 aa  333  3e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0581253  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0374  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.66 
 
 
335 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000361568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0083  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.5 
 
 
341 aa  332  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0118  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
334 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3998  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.88 
 
 
331 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3477  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.58 
 
 
332 aa  331  8e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>