More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0709 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
315 aa  644    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.58 
 
 
324 aa  420  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.12 
 
 
325 aa  401  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.28 
 
 
326 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.01 
 
 
329 aa  394  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
329 aa  393  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.41 
 
 
324 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.43 
 
 
325 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57 
 
 
322 aa  388  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  56.29 
 
 
328 aa  388  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.57 
 
 
329 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  55.21 
 
 
330 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.35 
 
 
326 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.33 
 
 
326 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.84 
 
 
325 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.89 
 
 
329 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  56.92 
 
 
330 aa  382  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.21 
 
 
326 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.43 
 
 
339 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.75 
 
 
324 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  55.8 
 
 
325 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 
326 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
339 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
337 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.15 
 
 
327 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.26 
 
 
325 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0923  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.43 
 
 
328 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.468149  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 
326 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.25 
 
 
326 aa  373  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.84 
 
 
327 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.85 
 
 
325 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0943  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.03 
 
 
328 aa  368  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.85 
 
 
325 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  54.43 
 
 
336 aa  368  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.11 
 
 
322 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.68 
 
 
323 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.16 
 
 
324 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.49 
 
 
322 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.8 
 
 
350 aa  363  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.29 
 
 
327 aa  363  2e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.37 
 
 
322 aa  362  3e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1435  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.89 
 
 
352 aa  362  4e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1520  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.77 
 
 
328 aa  362  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.86 
 
 
322 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  53 
 
 
324 aa  360  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  52.61 
 
 
326 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 
328 aa  359  3e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
325 aa  358  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.92 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.77 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00581953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.31 
 
 
325 aa  354  8.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  54.1 
 
 
327 aa  354  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4544  porphobilinogen synthase  55 
 
 
325 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.56 
 
 
343 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.09 
 
 
323 aa  353  2e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.74 
 
 
324 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
331 aa  352  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
329 aa  350  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 
321 aa  350  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.19 
 
 
321 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 
333 aa  349  3e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.15 
 
 
326 aa  349  4e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  50.31 
 
 
340 aa  349  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.2 
 
 
324 aa  347  1e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1073  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.06 
 
 
327 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.64 
 
 
341 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.65 
 
 
324 aa  345  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.45 
 
 
352 aa  346  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.26 
 
 
324 aa  345  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.44 
 
 
318 aa  345  7e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.26 
 
 
324 aa  345  7e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 
328 aa  344  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.32 
 
 
328 aa  344  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  50.78 
 
 
325 aa  342  4e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.61 
 
 
338 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.24 
 
 
327 aa  341  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  49.37 
 
 
325 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.04 
 
 
341 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.04 
 
 
341 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.93 
 
 
327 aa  338  5e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.86 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.73 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1200  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.04 
 
 
325 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.20821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
323 aa  335  3.9999999999999995e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.59 
 
 
356 aa  335  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
336 aa  335  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0925  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
326 aa  335  7e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.412734  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.39 
 
 
326 aa  334  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
323 aa  333  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0646  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.02 
 
 
322 aa  333  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.3 
 
 
327 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.43 
 
 
325 aa  332  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 
325 aa  332  6e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>