More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2392 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2392  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
332 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2260  delta-aminolevulinic acid dehydratase  97.59 
 
 
332 aa  627  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2183  delta-aminolevulinic acid dehydratase  96.99 
 
 
332 aa  623  1e-177  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2587  delta-aminolevulinic acid dehydratase  94.28 
 
 
333 aa  609  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1858  delta-aminolevulinic acid dehydratase  89.74 
 
 
327 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1885  delta-aminolevulinic acid dehydratase  90.06 
 
 
327 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2434  delta-aminolevulinic acid dehydratase  89.42 
 
 
327 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432476  normal  0.214406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1892  delta-aminolevulinic acid dehydratase  89.42 
 
 
327 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.3598 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1755  delta-aminolevulinic acid dehydratase  89.71 
 
 
327 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.539106  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0074  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.15 
 
 
346 aa  481  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0303  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.7 
 
 
332 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.942552  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0141  delta-aminolevulinic acid dehydratase  66.98 
 
 
327 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0171  delta-aminolevulinic acid dehydratase  61.27 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2426  delta-aminolevulinic acid dehydratase  62.3 
 
 
328 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.575079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3751  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.1 
 
 
324 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0528618  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2111  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.46 
 
 
324 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2913  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.46 
 
 
324 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2778  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.46 
 
 
324 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0997001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2870  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.46 
 
 
324 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0412  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.78 
 
 
324 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0466  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.78 
 
 
324 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0404  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.78 
 
 
324 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.956627  hitchhiker  0.00000000427813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0424  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.78 
 
 
324 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0516895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0406  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.78 
 
 
324 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00319  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
324 aa  358  9e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00323  hypothetical protein  56.83 
 
 
324 aa  358  9e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3238  Porphobilinogen synthase  56.83 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0444  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0433  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3259  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0393  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0284  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0398  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.83 
 
 
324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.8 
 
 
344 aa  350  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.227907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.51 
 
 
324 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
325 aa  340  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
326 aa  330  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  49.38 
 
 
328 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
322 aa  323  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.59 
 
 
339 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.96 
 
 
326 aa  321  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.28 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.91 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.39 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.74 
 
 
323 aa  318  7e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
326 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.29 
 
 
325 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.11 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.14 
 
 
326 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.2 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.77 
 
 
335 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.2 
 
 
327 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.6 
 
 
326 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.73 
 
 
352 aa  311  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  51.14 
 
 
327 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.11 
 
 
324 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.06 
 
 
325 aa  310  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.27 
 
 
323 aa  310  2e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.02 
 
 
337 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.17 
 
 
325 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  46.3 
 
 
325 aa  308  9e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.83 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.81 
 
 
325 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.25 
 
 
323 aa  306  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.81 
 
 
333 aa  306  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.88 
 
 
341 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.67 
 
 
315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.65 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.59 
 
 
341 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.59 
 
 
341 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.73 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  48.43 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.11 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  43.4 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.46 
 
 
327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.71 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.42 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.88 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  46.6 
 
 
330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0806  Porphobilinogen synthase  47.06 
 
 
340 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  45.2 
 
 
325 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 
324 aa  302  5.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.41 
 
 
326 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1583  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.73 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.789302  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02931  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.73 
 
 
332 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.462388  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.48 
 
 
326 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02361  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.63 
 
 
336 aa  301  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.984887  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.15 
 
 
327 aa  301  9e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  48.67 
 
 
324 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0015  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.56 
 
 
326 aa  300  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.767271 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.3 
 
 
326 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  47.9 
 
 
326 aa  300  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  47.53 
 
 
330 aa  300  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.29 
 
 
341 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1772  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.75 
 
 
331 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.27 
 
 
331 aa  297  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.17 
 
 
318 aa  296  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.57 
 
 
329 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>