More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0074 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0074  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
346 aa  722    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0303  delta-aminolevulinic acid dehydratase  85.67 
 
 
332 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.942552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1858  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.03 
 
 
327 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1885  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.7 
 
 
327 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1892  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.7 
 
 
327 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.3598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2434  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.06 
 
 
327 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432476  normal  0.214406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1755  delta-aminolevulinic acid dehydratase  69.97 
 
 
327 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.539106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2587  delta-aminolevulinic acid dehydratase  73.29 
 
 
333 aa  450  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2183  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.66 
 
 
332 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2392  delta-aminolevulinic acid dehydratase  72.31 
 
 
332 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2260  delta-aminolevulinic acid dehydratase  71.99 
 
 
332 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0141  delta-aminolevulinic acid dehydratase  63.17 
 
 
327 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0171  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.51 
 
 
324 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  58.05 
 
 
344 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.227907  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0406  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 
324 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0412  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 
324 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0404  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 
324 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.956627  hitchhiker  0.00000000427813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0424  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 
324 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0516895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0466  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.45 
 
 
324 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0398  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.86 
 
 
324 aa  359  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2426  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.68 
 
 
328 aa  358  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal  0.575079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00319  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00323  hypothetical protein  54.55 
 
 
324 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3238  Porphobilinogen synthase  54.55 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0433  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0393  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0284  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3259  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0444  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.49 
 
 
324 aa  355  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3751  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.77 
 
 
324 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0528618  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2870  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.27 
 
 
324 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2913  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.27 
 
 
324 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322875  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2778  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.27 
 
 
324 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0997001  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2111  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.63 
 
 
324 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.71 
 
 
325 aa  346  3e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.79 
 
 
326 aa  341  9e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
325 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.06 
 
 
352 aa  328  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.06 
 
 
323 aa  323  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
329 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.8 
 
 
325 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
326 aa  322  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  48.4 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3144  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0687619  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.08 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
329 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
329 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.11 
 
 
339 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 
322 aa  320  3e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.11 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.68 
 
 
325 aa  319  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.26 
 
 
325 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.88 
 
 
326 aa  316  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.47 
 
 
337 aa  315  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.03 
 
 
325 aa  315  8e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  47.02 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.68 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.23 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.48 
 
 
323 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.72 
 
 
327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  49.53 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.03 
 
 
327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  49.5 
 
 
324 aa  312  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.14 
 
 
321 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.45 
 
 
321 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.32 
 
 
335 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.94 
 
 
323 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.8 
 
 
341 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.8 
 
 
341 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  47 
 
 
330 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.8 
 
 
341 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  45.68 
 
 
325 aa  310  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.93 
 
 
341 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.89 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0507  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.55 
 
 
333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209563  normal  0.242099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36070  porphobilinogen synthase  47.38 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1828  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.95 
 
 
333 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.63 
 
 
324 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
327 aa  306  3e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  44.72 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  47.52 
 
 
330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1771  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.77 
 
 
331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.39 
 
 
322 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  47.04 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50723  predicted protein  48.61 
 
 
403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0509  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.83 
 
 
326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>