More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0215 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0215  delta-aminolevulinic acid dehydratase  100 
 
 
336 aa  691    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000475247  normal  0.0306727 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1161  Porphobilinogen synthase  69.64 
 
 
336 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.353722  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.47 
 
 
347 aa  418  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  60.3 
 
 
336 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.4 
 
 
336 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  59.64 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.27 
 
 
338 aa  389  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0153691 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.69 
 
 
329 aa  351  1e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.12 
 
 
324 aa  347  1e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0916  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
327 aa  342  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.09 
 
 
324 aa  339  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 
329 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.62 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1463  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
324 aa  335  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.66 
 
 
326 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.45 
 
 
322 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
326 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 
329 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.25 
 
 
326 aa  332  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  49.24 
 
 
328 aa  332  4e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2529  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 
326 aa  332  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
329 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
329 aa  332  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
329 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.07 
 
 
329 aa  332  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
329 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
329 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.91 
 
 
329 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.15 
 
 
322 aa  332  8e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 
329 aa  330  1e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.6 
 
 
329 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  51.08 
 
 
325 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.76 
 
 
324 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  49.39 
 
 
330 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 
326 aa  328  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.49 
 
 
327 aa  328  9e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.38 
 
 
324 aa  328  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.6 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.86 
 
 
326 aa  325  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2986  Porphobilinogen synthase  52.83 
 
 
348 aa  325  7e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199631  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  52.1 
 
 
336 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.63 
 
 
325 aa  325  9e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
339 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1228  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 
318 aa  323  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000110941  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
321 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.37 
 
 
331 aa  323  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1344  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.38 
 
 
322 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.851978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
321 aa  323  3e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0524  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 
315 aa  323  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0925599  normal  0.564293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1016  Porphobilinogen synthase  50.15 
 
 
325 aa  322  5e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
339 aa  322  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02880  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.32 
 
 
323 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0141846  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 
323 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24380  porphobilinogen synthase  48.78 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.714511  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.38 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.3 
 
 
352 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.24 
 
 
337 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.85 
 
 
325 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.8 
 
 
341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  49.85 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6727  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.4 
 
 
324 aa  319  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0050  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.85 
 
 
317 aa  319  5e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  51.75 
 
 
326 aa  318  9e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.37 
 
 
341 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 
324 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 
324 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0573  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
346 aa  316  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000688177  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.78 
 
 
334 aa  316  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000102643  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  45.9 
 
 
327 aa  316  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000429101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
325 aa  315  5e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2576  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.26 
 
 
331 aa  315  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4525  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 
329 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10523  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.29 
 
 
329 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  50.93 
 
 
325 aa  315  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.77 
 
 
341 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.77 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1560  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0264  Porphobilinogen synthase  51.83 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0195547  normal  0.736079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1584  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
328 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.845142  normal  0.720869 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0688  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.62 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000853777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0981  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.13 
 
 
327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.92 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4300  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.98 
 
 
343 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  53.09 
 
 
324 aa  311  6.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  50.76 
 
 
325 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.1 
 
 
335 aa  311  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  51.76 
 
 
327 aa  311  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1236  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.11 
 
 
325 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.23 
 
 
323 aa  310  2e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.15 
 
 
327 aa  310  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6128  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.91 
 
 
338 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00369779  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0252  Porphobilinogen synthase  49.55 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.550622  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0064  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.73 
 
 
326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.812173  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3297  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.76 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.267126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4577  Porphobilinogen synthase  50 
 
 
344 aa  308  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>